More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0964 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 306 aa  608  1e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.15 
 
 		 317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.88 
 
 		 272 aa  287  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.5 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.6 
 
 		 278 aa  256  3e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.719818  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.71 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 		 285 aa  200  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 		 280 aa  195  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.83 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0560563  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  39.32 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.41 
 
 		 285 aa  192  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  37.33 
 
 		 278 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  38.68 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  36.95 
 
 		 287 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  38.06 
 
 		 283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 		 291 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  39.16 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.99 
 
 		 272 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 272 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  39.02 
 
 		 278 aa  181  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.51 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  34.27 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  47.39 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  38.41 
 
 		 277 aa  175  7e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  47.52 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 		 284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  42.25 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  35.93 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.41 
 
 		 287 aa  165  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1005  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  34.84 
 
 		 276 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  35.4 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  38.97 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01319  short chain dehydrogenase  35.07 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  39.26 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 		 267 aa  163  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 		 284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 284 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  31.58 
 
 		 272 aa  162  6e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 269 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  39.41 
 
 		 280 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  38.05 
 
 		 271 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  47.06 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  37.59 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.07 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.72 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  37.32 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  45.05 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 276 aa  159  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  45.99 
 
 		 270 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  46.52 
 
 		 274 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.28 
 
 		 307 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.28 
 
 		 307 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.17 
 
 		 272 aa  158  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2186  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.81 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004148  putative oxidoreductase  32.64 
 
 		 275 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  43.59 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  37.41 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0805  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 		 275 aa  157  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4006  short chain dehydrogenase  33.45 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 		 272 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3557  short chain dehydrogenase  42.47 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18665  normal  0.726998 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00444  short chain dehydrogenase  41.85 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0428  short chain dehydrogenase  41.85 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0532  short chain dehydrogenase  41.85 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 275 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0572  short chain dehydrogenase  41.85 
 
 		 269 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  40.55 
 
 		 277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00449  hypothetical protein  41.85 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.85 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0597  short chain dehydrogenase  41.85 
 
 		 269 aa  155  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.853747 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  37.63 
 
 		 286 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1018  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 		 298 aa  155  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176999  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1156  short chain dehydrogenase  41.62 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565879  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3123  short chain dehydrogenase  41.85 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111305 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  45.88 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1977  short chain dehydrogenase  34.03 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1902  short chain dehydrogenase  34.03 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3850  short chain dehydrogenase  35.49 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0967  short chain dehydrogenase  41.08 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1694  short-chain dehydrogenase/reductase  34.84 
 
 		 271 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 276 aa  153  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 		 271 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0407842  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1121  short chain dehydrogenase  42.25 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0921359  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 		 285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.87 
 
 		 283 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>