More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0087 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0087  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
325 aa  638    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0770  alcohol dehydrogenase  49.22 
 
 
321 aa  287  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00613196  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1113  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.65 
 
 
320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1144  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.03 
 
 
323 aa  240  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.129111 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0992  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.81 
 
 
326 aa  231  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3256  alcohol dehydrogenase  32.75 
 
 
345 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0246  alcohol dehydrogenase  35.17 
 
 
343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000123303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.54 
 
 
343 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00243149  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.67 
 
 
341 aa  167  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000121162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.17 
 
 
346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3405  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.31 
 
 
348 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0198026  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  31.27 
 
 
337 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  31.91 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 
336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  30.66 
 
 
349 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  29.82 
 
 
335 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  29.82 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.32 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.75 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 
327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.44 
 
 
335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7070  alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 
346 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1030  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.49 
 
 
346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0743662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2145  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  31.41 
 
 
346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  30.15 
 
 
345 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1218  alcohol dehydrogenase  29.18 
 
 
361 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852101  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  28.9 
 
 
338 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3165  alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 
352 aa  129  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.84 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5590  alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 
354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.86 
 
 
346 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.41128  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.33 
 
 
338 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  26.79 
 
 
345 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.29 
 
 
349 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  27.86 
 
 
336 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.56 
 
 
336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.53 
 
 
367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.93 
 
 
333 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3230  alcohol dehydrogenase  29.6 
 
 
338 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.87 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  31.12 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  28.9 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.78 
 
 
336 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.66 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  28.87 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1608  putative Zn-dependent dehydrogenase  28.53 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.587808  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0262  alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0286  alcohol dehydrogenase  28.91 
 
 
330 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.24 
 
 
337 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.17 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  25.81 
 
 
318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  30.22 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  27.86 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.36 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  28.79 
 
 
336 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.55 
 
 
340 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  28.08 
 
 
344 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.79 
 
 
344 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.55 
 
 
340 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  27.55 
 
 
340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.55 
 
 
340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  27.55 
 
 
340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.55 
 
 
340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  28.36 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.23 
 
 
347 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.87 
 
 
338 aa  109  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  28.3 
 
 
338 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.43 
 
 
340 aa  109  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  28.36 
 
 
341 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  28.36 
 
 
341 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  28.75 
 
 
338 aa  109  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  25.48 
 
 
317 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  28.36 
 
 
341 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4840  alcohol dehydrogenase  29.59 
 
 
330 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  28.06 
 
 
341 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.8 
 
 
340 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.12 
 
 
340 aa  106  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  26.09 
 
 
351 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  26.09 
 
 
351 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  27.39 
 
 
341 aa  106  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  30.04 
 
 
339 aa  106  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3849  alcohol dehydrogenase  27.65 
 
 
336 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3317  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.85 
 
 
338 aa  105  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  hitchhiker  0.0000240679 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  27.03 
 
 
359 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1653  starvation sensing protein RspB  34.46 
 
 
288 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00258422  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2517  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.67 
 
 
335 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  27.73 
 
 
356 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  31.31 
 
 
352 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  34.46 
 
 
339 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.46 
 
 
339 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.08 
 
 
352 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  34.46 
 
 
339 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  33.9 
 
 
339 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.2 
 
 
325 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  27.8 
 
 
340 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  27.18 
 
 
336 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0607  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  30.41 
 
 
324 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420026  normal  0.0271059 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4721  alcohol dehydrogenase  27.81 
 
 
362 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.33 
 
 
347 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>