More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4852 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
884 aa  1803    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.33 
 
 
911 aa  602  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 
905 aa  565  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.21 
 
 
880 aa  553  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
2153 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
2161 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
2783 aa  369  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
3470 aa  352  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
885 aa  327  5e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 
718 aa  233  8.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 
711 aa  229  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 
719 aa  224  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.688425  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 
695 aa  224  8e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
815 aa  222  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 
725 aa  220  8.999999999999998e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
958 aa  218  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4649  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
533 aa  214  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 
726 aa  210  8e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0662755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 
677 aa  210  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
701 aa  205  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.71 
 
 
944 aa  197  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 
722 aa  196  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0937  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
534 aa  193  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0830916  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
899 aa  192  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
1042 aa  192  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.55 
 
 
556 aa  190  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
1064 aa  189  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
899 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
556 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
546 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 
1319 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 
758 aa  185  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
508 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 
456 aa  184  7e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 
687 aa  183  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  29.61 
 
 
762 aa  182  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.79 
 
 
1021 aa  183  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 
421 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
755 aa  181  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
754 aa  179  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
612 aa  179  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 
458 aa  178  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
1039 aa  179  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
596 aa  177  8e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  30.35 
 
 
1046 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 
933 aa  177  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
1010 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
590 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3217  ATP-binding region ATPase domain protein  35.52 
 
 
576 aa  175  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.644054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
492 aa  174  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0351302  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
827 aa  174  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
752 aa  173  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
763 aa  173  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.508031  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 
599 aa  172  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
637 aa  172  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
718 aa  172  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
893 aa  172  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
1043 aa  171  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
511 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 
625 aa  170  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.09 
 
 
1068 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 
489 aa  169  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3102  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 
1211 aa  169  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  38.96 
 
 
461 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
608 aa  167  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
874 aa  167  8e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
371 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 
590 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  34.83 
 
 
537 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.85 
 
 
1131 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  37.9 
 
 
461 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
639 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0053  two component sensor histidine kinase  31.78 
 
 
867 aa  165  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  37.9 
 
 
461 aa  165  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  28.03 
 
 
617 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.38 
 
 
1816 aa  164  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1274 aa  164  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
634 aa  164  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
1060 aa  164  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  30.94 
 
 
470 aa  163  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.49 
 
 
1917 aa  163  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.35 
 
 
1038 aa  164  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
600 aa  163  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
546 aa  162  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
585 aa  163  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.14 
 
 
1002 aa  163  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  35.69 
 
 
508 aa  162  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2123  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
688 aa  161  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.267371  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  32.48 
 
 
346 aa  161  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.87 
 
 
1131 aa  161  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
608 aa  160  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3128  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
680 aa  160  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 
1977 aa  160  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
556 aa  160  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.936608  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
503 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 
595 aa  160  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 
509 aa  160  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  25.57 
 
 
1278 aa  160  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
906 aa  160  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
612 aa  159  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>