80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0293 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 511 aa  1042    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  72.97 
 
 		 609 aa  670    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 477 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  33.48 
 
 		 460 aa  189  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  28.46 
 
 		 1152 aa  128  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  26.03 
 
 		 465 aa  120  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  27.74 
 
 		 1223 aa  107  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  28.63 
 
 		 543 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 1140 aa  87.4  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  25.65 
 
 		 1140 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  25.8 
 
 		 1140 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  26.75 
 
 		 2690 aa  82.4  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  23.68 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  23.67 
 
 		 1129 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3714  licheninase  26.76 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3207  glycoside hydrolase family protein  23.58 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  27.07 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1258  glycoside hydrolase family 8  22.19 
 
 		 376 aa  66.6  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  23.5 
 
 		 477 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4314  glycoside hydrolase family protein  23.26 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0086  chitosanase  25.19 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2695  chitosanase  25.45 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.855226  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  23.76 
 
 		 1748 aa  58.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2615  chitosanase  25.45 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.978313  hitchhiker  0.00000219507 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2673  chitosanase  26.27 
 
 		 453 aa  57  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2490  chitosanase  26.27 
 
 		 453 aa  57  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551082  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  23.86 
 
 		 445 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2687  chitosanase  25 
 
 		 453 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128394 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  30 
 
 		 332 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  25 
 
 		 571 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  32.06 
 
 		 332 aa  55.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  22.07 
 
 		 912 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  21.77 
 
 		 430 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5210  cellulase  30.3 
 
 		 344 aa  55.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  34.45 
 
 		 691 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2421  chitosanase  24.74 
 
 		 453 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00349071  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1409  glycoside hydrolase family 8  21.68 
 
 		 432 aa  54.3  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  28.19 
 
 		 390 aa  53.9  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  54.67 
 
 		 914 aa  53.9  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  38.64 
 
 		 366 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  30.95 
 
 		 2807 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  27.27 
 
 		 330 aa  51.6  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  24.83 
 
 		 468 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0686  endo-1,4-D-glucanase  28.86 
 
 		 437 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 628 aa  50.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1589  endo-1,4-D-glucanase  28.86 
 
 		 514 aa  50.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390235  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2145  endo-1,4-D-glucanase  28.86 
 
 		 520 aa  50.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246354  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2008  endo-1,4-D-glucanase  28.86 
 
 		 508 aa  50.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  23.45 
 
 		 2772 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0231  glycoside hydrolase family 8  23.18 
 
 		 429 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  33.73 
 
 		 376 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2263  glycoside hydrolase family protein  24.73 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.374897  normal  0.190888 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0964  cellulase  25.94 
 
 		 356 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  28.3 
 
 		 348 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  53.12 
 
 		 1394 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2231  endo-1,4-D-glucanase  28.86 
 
 		 506 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0632  endo-1,4-D-glucanase  28.86 
 
 		 506 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.585544  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  50 
 
 		 830 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3928  endo-1,4-D-glucanase  28.02 
 
 		 360 aa  47.4  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0273  cellulase  27.06 
 
 		 384 aa  47  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1432  endoglucanase Y  25.48 
 
 		 377 aa  46.6  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1976  cellulase  25.85 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65444  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  26.67 
 
 		 419 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  26.67 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  42.53 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4175  hypothetical protein  24.46 
 
 		 362 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  50.79 
 
 		 846 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  36.78 
 
 		 337 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  26.2 
 
 		 421 aa  45.8  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0331  hypothetical protein  25.85 
 
 		 612 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0150  endo-1,4-D-glucanase  27.83 
 
 		 370 aa  45.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4070  endo-1,4-D-glucanase  29.6 
 
 		 371 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2071  endo-1,4-D-glucanase  25.86 
 
 		 379 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124631 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0093  endo-1,4-D-glucanase  29.6 
 
 		 371 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0186  endo-1,4-D-glucanase  26.85 
 
 		 368 aa  44.7  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1292  endo-1,4-D-glucanase  27.88 
 
 		 406 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0452609  normal  0.0578777 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2684  glycoside hydrolase family protein  25.62 
 
 		 292 aa  44.3  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1925  endo-1,4-D-glucanase  26.69 
 
 		 414 aa  43.9  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4803  Cellulase  27.78 
 
 		 385 aa  43.9  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4526  endo-1,4-D-glucanase  28.43 
 
 		 409 aa  43.5  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00393653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>