156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0992 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  100 
 
 		 195 aa  393  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  42.26 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0347  hypothetical protein  40.7 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000102624  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  40.7 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_287  hypothetical protein  40.12 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000717319  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1143  hypothetical protein  35.03 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4033  protein of unknown function DUF88  34.29 
 
 		 226 aa  98.2  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.424874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3991  protein of unknown function DUF88  34.29 
 
 		 226 aa  98.2  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2722  hypothetical protein  36.59 
 
 		 209 aa  98.2  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353362  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1805  hypothetical protein  34.27 
 
 		 204 aa  98.2  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000048787 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4859  hypothetical protein  36.59 
 
 		 210 aa  98.2  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0181079  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3333  protein of unknown function DUF88  36.36 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.258648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0096  protein of unknown function DUF88  35.37 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.263134 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1835  hypothetical protein  32.52 
 
 		 194 aa  94.4  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2466  hypothetical protein  33.91 
 
 		 228 aa  88.2  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0528  hypothetical protein  35.83 
 
 		 190 aa  88.2  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0275005  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1943  hypothetical protein  33.73 
 
 		 236 aa  86.3  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.423508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1723  hypothetical protein  33.15 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.761661  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1877  hypothetical protein  31.49 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000471771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0379  protein of unknown function DUF88  30.22 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.31368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0675  hypothetical protein  31.76 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1144  protein of unknown function DUF88  32.35 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1440  hypothetical protein  31.76 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1195  protein of unknown function DUF88  33.54 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0944  hypothetical protein  31.76 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0294476  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0543  hypothetical protein  30.64 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0589546  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2865  hypothetical protein  29.89 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414585  normal  0.0571664 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0991  protein of unknown function DUF88  31.76 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.727303  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_004310  BR0649  hypothetical protein  31.76 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2638  hypothetical protein  31.76 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3517  protein of unknown function DUF88  29.95 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3193  hypothetical protein  29.95 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.951691 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1000  protein of unknown function DUF88  30.77 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1859  hypothetical protein  30.23 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00561567  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2447  hypothetical protein  31.36 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5380  protein of unknown function DUF88  29.14 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.458157 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3389  protein of unknown function DUF88  29.89 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  30.27 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0165  protein of unknown function DUF88  29.76 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.334163 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  30.27 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3836  hypothetical protein  31.32 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  29.73 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  29.67 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1873  protein of unknown function DUF88  27.62 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1847  protein of unknown function DUF88  27.62 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1924  hypothetical protein  30.94 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2257  hypothetical protein  30.39 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1893  hypothetical protein  29.12 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569824  hitchhiker  0.00176101 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0673  protein of unknown function DUF88  27.33 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.696503  normal  0.0525429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2633  hypothetical protein  31.15 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0521932  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2873  protein of unknown function DUF88  25.77 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2645  hypothetical protein  31.18 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  hitchhiker  0.00814137 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1578  hypothetical protein  32.16 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0544432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0033  hypothetical protein  30.59 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2805  hypothetical protein  30.98 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2746  protein of unknown function DUF88  26.74 
 
 		 165 aa  64.3  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0482662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0035  protein of unknown function DUF88  30 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153842  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0796  protein of unknown function DUF88  27.33 
 
 		 165 aa  64.3  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2966  protein of unknown function DUF88  32.62 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180481  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2606  hypothetical protein  31.18 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0253982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3645  protein of unknown function DUF88  26.32 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3179  protein of unknown function DUF88  25 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.488088  normal  0.175977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4689  hypothetical protein  30.05 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501693  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2781  hypothetical protein  26.09 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0945  hypothetical protein  27.53 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.279417 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  29.12 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  29.82 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5741  protein of unknown function DUF88  30.16 
 
 		 435 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0769701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1891  hypothetical protein  26.92 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248989  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1654  protein of unknown function DUF88  26.67 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0466931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0511  hypothetical protein  31.79 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0671  hypothetical protein  26.52 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2110  hypothetical protein  25.29 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850864  normal  0.350459 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4322  hypothetical protein  25.29 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.31115  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0396  hypothetical protein  30.17 
 
 		 393 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0224  protein of unknown function DUF88  25 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121246  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4322  hypothetical protein  25 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.833366  normal  0.664553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4688  protein of unknown function DUF88  24.58 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.706781  normal  0.898673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  29.71 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0183  hypothetical protein  29.17 
 
 		 468 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0923837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4611  protein of unknown function DUF88  29.89 
 
 		 574 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0253473  normal  0.838732 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  35.35 
 
 		 305 aa  55.1  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2008  protein of unknown function DUF88  27.49 
 
 		 304 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888225  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2514  hypothetical protein  29.78 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0312456  normal  0.44225 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0433  protein of unknown function DUF88  28.95 
 
 		 294 aa  53.1  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2303  protein of unknown function DUF88  26.95 
 
 		 168 aa  52.8  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0758  hypothetical protein  27.54 
 
 		 158 aa  52  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05689  hypothetical protein  27.98 
 
 		 162 aa  52  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2275  protein of unknown function DUF88  27.53 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3258  hypothetical protein  27.22 
 
 		 157 aa  51.2  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  42.86 
 
 		 421 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2003  hypothetical protein  25.6 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212365  normal  0.0101552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3359  hypothetical protein  30.72 
 
 		 404 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0482  hypothetical protein  27.5 
 
 		 287 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  37.8 
 
 		 275 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000074  hypothetical protein  27.98 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0226  protein of unknown function DUF88  26.26 
 
 		 446 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  42.86 
 
 		 472 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1733  protein of unknown function DUF88  25.91 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.131677  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  42.86 
 
 		 483 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>