275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4099 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  66.11 
 
 
477 aa  641    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
478 aa  956    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  63.81 
 
 
477 aa  629  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  44.51 
 
 
465 aa  365  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  39.92 
 
 
456 aa  325  9e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3755  flagellar hook-associated protein FlgK  41.98 
 
 
482 aa  323  6e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3839  flagellar hook-associated protein FlgK  42.27 
 
 
480 aa  317  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0049763 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  36.4 
 
 
464 aa  242  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  33.33 
 
 
471 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  32.86 
 
 
480 aa  230  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  32.44 
 
 
486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  30.67 
 
 
531 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  29.32 
 
 
525 aa  211  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  28.89 
 
 
541 aa  193  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  29.77 
 
 
464 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  29.07 
 
 
489 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  32.24 
 
 
482 aa  190  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  31.19 
 
 
458 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  29.05 
 
 
457 aa  173  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  33.05 
 
 
459 aa  172  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  30.32 
 
 
463 aa  172  9e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  27.44 
 
 
454 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  27.09 
 
 
457 aa  163  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  30.06 
 
 
443 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  33.92 
 
 
647 aa  160  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  29.89 
 
 
637 aa  160  7e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  29.75 
 
 
838 aa  158  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  32.71 
 
 
652 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2243  flagellar hook-associated protein FlgK  29.92 
 
 
519 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  28.65 
 
 
537 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  34.62 
 
 
560 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  31.83 
 
 
568 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  28.01 
 
 
463 aa  153  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  28.73 
 
 
858 aa  153  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  28.73 
 
 
858 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0672  flagellar hook-associated protein FlgK  26.3 
 
 
430 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0730204 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31330  flagellar hook-associated protein FlgK  29.28 
 
 
475 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  31.05 
 
 
547 aa  150  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  30.79 
 
 
547 aa  150  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  36.55 
 
 
702 aa  150  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  30.79 
 
 
547 aa  149  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  30.79 
 
 
547 aa  149  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  30.79 
 
 
547 aa  149  9e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  30.79 
 
 
547 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  30.79 
 
 
547 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  31.25 
 
 
547 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  31.25 
 
 
547 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  32.12 
 
 
920 aa  148  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  28.48 
 
 
583 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  35.29 
 
 
698 aa  143  7e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  28.9 
 
 
457 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  35 
 
 
638 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  30.68 
 
 
685 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  29.79 
 
 
554 aa  141  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  29.79 
 
 
554 aa  141  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  29.79 
 
 
554 aa  141  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  32.28 
 
 
682 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  33.54 
 
 
688 aa  140  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  29.41 
 
 
546 aa  140  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  32.84 
 
 
683 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  26.93 
 
 
457 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  35.57 
 
 
642 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0094  flagellar hook-associated protein FlgK  28.64 
 
 
708 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  27.08 
 
 
457 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  36.03 
 
 
645 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  36.03 
 
 
645 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  26.32 
 
 
623 aa  136  8e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 
475 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  27.81 
 
 
846 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  28.27 
 
 
457 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  31.45 
 
 
696 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  27.46 
 
 
457 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  31.79 
 
 
553 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  31.79 
 
 
553 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  31.79 
 
 
553 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  31.79 
 
 
553 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  31.79 
 
 
553 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  30.24 
 
 
631 aa  133  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0248  flagellar hook-associated protein FlgK  33.04 
 
 
570 aa  132  9e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  31.53 
 
 
682 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  27.78 
 
 
847 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  29.43 
 
 
566 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  33.05 
 
 
637 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  32.73 
 
 
541 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  30.9 
 
 
548 aa  131  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  29.13 
 
 
539 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  34.68 
 
 
715 aa  130  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0665  flagellar hook-associated protein FlgK  29.17 
 
 
858 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  29.3 
 
 
676 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0215  flagellar hook-associated protein FlgK  28.14 
 
 
455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727542  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2445  flagellar hook-associated protein  24.58 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0769  flagellar hook-associated protein FlgK  28.48 
 
 
466 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1344  flagellar hook-associated protein  28.38 
 
 
469 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0451355  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  27.01 
 
 
614 aa  127  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  26.84 
 
 
627 aa  127  6e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  27.86 
 
 
818 aa  126  9e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  30.79 
 
 
680 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2513  flagellar hook-associated protein FlgK  28.76 
 
 
469 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00819132  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  25.58 
 
 
458 aa  126  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  31.83 
 
 
640 aa  125  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>