233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2887 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2887  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  507  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1541  hypothetical protein  67.52 
 
 		 267 aa  340  9e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.463797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2563  protein of unknown function DUF1568  42.16 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1914  protein of unknown function DUF1568  55.65 
 
 		 124 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2564  hypothetical protein  41.61 
 
 		 170 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  29.56 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  29.09 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  36.45 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  30.81 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  37.62 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  35.51 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  37.5 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  37.23 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  25.54 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  25.67 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  34.82 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  36.56 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  32.69 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  34.95 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  25.85 
 
 		 316 aa  72  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  26.09 
 
 		 322 aa  72  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  31.3 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  32.71 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  32.17 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  29.1 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  33.62 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  32.04 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  32.74 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  28.85 
 
 		 228 aa  67  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  30.09 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  34.55 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  31.37 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  23.24 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  32.98 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  25.25 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  31.07 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  27.97 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  29.46 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  30.77 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  28.21 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  25 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  25 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  24.23 
 
 		 241 aa  62  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  31.52 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  31.07 
 
 		 237 aa  62  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  26.62 
 
 		 289 aa  62  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  32.43 
 
 		 312 aa  62  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  30.1 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  30.1 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  31.13 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3264  hypothetical protein  31.03 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0926373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  30.1 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  30.1 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  30.1 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  30.1 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  34.31 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  24.62 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  24.86 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  29.13 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  30.21 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  31.03 
 
 		 1372 aa  59.7  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3127  hypothetical protein  31.52 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  27.62 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  33.33 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03381  hypothetical protein  32.26 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.593355 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000852823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  28.85 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  27.49 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  26.53 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3749  hypothetical protein  29.13 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2788  hypothetical protein  29.13 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  29.13 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  29.13 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  29.13 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  29.41 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0179  hypothetical protein  35.35 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3691  hypothetical protein  29.13 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  34.91 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3215  hypothetical protein  29.13 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  29.23 
 
 		 316 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  27.03 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  29 
 
 		 1345 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  35.48 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  30.69 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27481  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.581269 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13701  hypothetical protein  31.18 
 
 		 164 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  31.53 
 
 		 282 aa  54.7  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  28.57 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  27.59 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0968  hypothetical protein  26.06 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  26.76 
 
 		 305 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  21.3 
 
 		 461 aa  54.3  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  29.03 
 
 		 174 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  25.21 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  32.91 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  25.71 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26971  hypothetical protein  32.26 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  32.14 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0309  hypothetical protein  33.04 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359735  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  27.78 
 
 		 327 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>