40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0968 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0968  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  471  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0965  hypothetical protein  90.91 
 
 
242 aa  363  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4099  protein of unknown function DUF1568  73 
 
 
235 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000116194  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0084  protein of unknown function DUF1568  72.08 
 
 
245 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3956  hypothetical protein  73.5 
 
 
241 aa  298  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.326054  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0096  protein of unknown function DUF1568  70.09 
 
 
240 aa  292  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243047  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4066  protein of unknown function DUF1568  72.65 
 
 
235 aa  292  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.557578  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0078  hypothetical protein  72.17 
 
 
236 aa  291  9e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.636604  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2512  hypothetical protein  44.98 
 
 
228 aa  165  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0641457  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2887  hypothetical protein  26.06 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1541  hypothetical protein  26.52 
 
 
267 aa  52.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.463797  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  35 
 
 
318 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0179  hypothetical protein  24.64 
 
 
254 aa  49.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27031  hypothetical protein  30.37 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  32.76 
 
 
310 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3485  hypothetical protein  23.45 
 
 
260 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36702  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26971  hypothetical protein  30.37 
 
 
260 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2620  hypothetical protein  23.7 
 
 
254 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000852823  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27481  hypothetical protein  29.79 
 
 
260 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.581269 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  34.18 
 
 
313 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  29.55 
 
 
315 aa  46.2  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  31.25 
 
 
216 aa  45.4  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  33.67 
 
 
304 aa  45.8  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  31.4 
 
 
165 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  36.25 
 
 
316 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  30.77 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  27.59 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  30.48 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2321  hypothetical protein  34.78 
 
 
297 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0102584 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0902  hypothetical protein  22.76 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  27.59 
 
 
258 aa  43.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  30.48 
 
 
208 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  30.7 
 
 
321 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  31.76 
 
 
235 aa  42.4  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  29.07 
 
 
241 aa  42.7  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3264  hypothetical protein  30.58 
 
 
247 aa  42.4  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0926373  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  25.3 
 
 
224 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  29.17 
 
 
319 aa  42  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  28.24 
 
 
251 aa  42  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  25.84 
 
 
250 aa  41.6  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>