23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0078 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0078  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  461  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.636604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0096  protein of unknown function DUF1568  87.5 
 
 
240 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243047  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3956  hypothetical protein  88.28 
 
 
241 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.326054  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4099  protein of unknown function DUF1568  83.98 
 
 
235 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000116194  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4066  protein of unknown function DUF1568  84.42 
 
 
235 aa  363  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.557578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0084  protein of unknown function DUF1568  78.95 
 
 
245 aa  359  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0968  hypothetical protein  73.04 
 
 
242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0965  hypothetical protein  73.04 
 
 
242 aa  271  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2512  hypothetical protein  41.74 
 
 
228 aa  155  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0641457  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  36.59 
 
 
304 aa  49.7  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1541  hypothetical protein  29.07 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.463797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2887  hypothetical protein  29.07 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  28.35 
 
 
231 aa  45.8  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  32.1 
 
 
318 aa  45.4  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  30.99 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  32.56 
 
 
316 aa  42.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3264  hypothetical protein  34.15 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0926373  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  32.1 
 
 
313 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  32.14 
 
 
234 aa  42.7  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  25.71 
 
 
253 aa  42.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  30.99 
 
 
232 aa  42.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  34.15 
 
 
315 aa  41.6  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  26.09 
 
 
258 aa  41.6  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>