239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4762 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 471 aa  930    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  74.57 
 
 		 464 aa  652    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  72.94 
 
 		 463 aa  631  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  72.69 
 
 		 464 aa  623  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  63.89 
 
 		 507 aa  550  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  60.81 
 
 		 456 aa  504  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  60.39 
 
 		 518 aa  495  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  62.31 
 
 		 455 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  59.69 
 
 		 448 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  54.49 
 
 		 467 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  53.85 
 
 		 467 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  52.97 
 
 		 467 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  53.33 
 
 		 475 aa  418  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 550 aa  415  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  50.2 
 
 		 546 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  46.28 
 
 		 548 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  48.24 
 
 		 575 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  48.24 
 
 		 575 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  46.55 
 
 		 553 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  47.52 
 
 		 554 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  52.4 
 
 		 467 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  45.99 
 
 		 538 aa  402  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  47.84 
 
 		 549 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  46.44 
 
 		 553 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  46.05 
 
 		 545 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  47.03 
 
 		 549 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  47.5 
 
 		 549 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  48.67 
 
 		 552 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  47.33 
 
 		 552 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  47.68 
 
 		 552 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  46.55 
 
 		 545 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  49.49 
 
 		 552 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  46.35 
 
 		 545 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  46.44 
 
 		 545 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  46.64 
 
 		 553 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  46.17 
 
 		 547 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  47.39 
 
 		 553 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  46.83 
 
 		 553 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  45.51 
 
 		 551 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  47.01 
 
 		 553 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  46.81 
 
 		 537 aa  375  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  46.31 
 
 		 558 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  46.37 
 
 		 566 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  44.05 
 
 		 556 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  46.4 
 
 		 556 aa  364  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1386  major facilitator transporter  41.25 
 
 		 570 aa  364  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.863121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  39.08 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  42.99 
 
 		 421 aa  277  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  42.99 
 
 		 424 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 412 aa  268  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  37.35 
 
 		 418 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 411 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  40.62 
 
 		 413 aa  261  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  37.33 
 
 		 424 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  39.29 
 
 		 406 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  37.69 
 
 		 397 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  37.82 
 
 		 401 aa  229  9e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  33.55 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 442 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 453 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0820  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  34.1 
 
 		 938 aa  144  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 421 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 421 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 421 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  30.38 
 
 		 438 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 419 aa  120  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 415 aa  117  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 407 aa  117  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 432 aa  117  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32095  predicted protein  37.2 
 
 		 679 aa  110  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  24.65 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  23.95 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 408 aa  106  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  23.72 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000021703  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  24.07 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  23.72 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  23.72 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  27.11 
 
 		 410 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 408 aa  103  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  24.19 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  24.19 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 407 aa  100  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  26.4 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  26.17 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  25.38 
 
 		 402 aa  99  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>