More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3321 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
702 aa  1382    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0198  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.6 
 
 
715 aa  470  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.419669  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20550  methyl-accepting chemotaxis protein  36.34 
 
 
733 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.375054  normal  0.44591 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.48 
 
 
710 aa  372  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142887  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33 
 
 
699 aa  362  2e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1336  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  36.19 
 
 
740 aa  359  8e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000730785  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 
718 aa  349  1e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  32.77 
 
 
998 aa  323  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2467  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  29.75 
 
 
729 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.73 
 
 
686 aa  299  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 
977 aa  272  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  47.88 
 
 
518 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1077  sensory box/GGDEF family protein  33.55 
 
 
808 aa  259  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  45.04 
 
 
545 aa  257  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3046  putative PAS/PAC sensor protein  37.17 
 
 
660 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.06 
 
 
545 aa  246  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.33 
 
 
522 aa  241  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  45.4 
 
 
542 aa  240  5e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.88 
 
 
528 aa  239  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30940  methyl-accepting chemotaxis protein  46.63 
 
 
407 aa  237  6e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682285  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.51 
 
 
547 aa  232  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.53 
 
 
537 aa  229  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  46.73 
 
 
531 aa  228  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.2 
 
 
542 aa  227  5.0000000000000005e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.54 
 
 
532 aa  227  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.570256  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  42.77 
 
 
347 aa  225  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  46.95 
 
 
562 aa  224  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.08 
 
 
544 aa  223  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3504  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.29 
 
 
657 aa  223  8e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193477  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.34 
 
 
1150 aa  221  5e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.09 
 
 
546 aa  219  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.94 
 
 
394 aa  219  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.9 
 
 
523 aa  219  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00385179  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  46.55 
 
 
538 aa  219  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.62 
 
 
538 aa  218  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.54 
 
 
538 aa  218  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  44.44 
 
 
540 aa  217  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  44 
 
 
543 aa  216  9e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  46.67 
 
 
533 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.68 
 
 
535 aa  215  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286616  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  44.97 
 
 
540 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.96 
 
 
904 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  44.94 
 
 
535 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.22 
 
 
558 aa  214  4.9999999999999996e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75846  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27420  methyl-accepting chemotaxis protein  46.38 
 
 
540 aa  213  7.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  49 
 
 
530 aa  212  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.61 
 
 
623 aa  211  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.308823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5010  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.99 
 
 
538 aa  211  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.96 
 
 
858 aa  210  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.47 
 
 
533 aa  210  6e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0651  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.99 
 
 
535 aa  209  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406234  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3089  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.4 
 
 
526 aa  204  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.65 
 
 
530 aa  204  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.36 
 
 
650 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4191  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.54 
 
 
538 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.75 
 
 
538 aa  199  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018308  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  32.49 
 
 
549 aa  198  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3136  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  32.81 
 
 
661 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598743  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.19 
 
 
529 aa  197  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30920  methyl-accepting chemotaxis protein  44.44 
 
 
583 aa  196  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.14 
 
 
531 aa  196  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.54 
 
 
536 aa  194  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1913  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.37 
 
 
524 aa  192  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0934644  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3066  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.89 
 
 
662 aa  191  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.28 
 
 
662 aa  191  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.45 
 
 
719 aa  190  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.69 
 
 
545 aa  189  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0156977  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1510  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.62 
 
 
574 aa  189  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00534894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  45.51 
 
 
533 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30960  methyl-accepting chemotaxis protein  52.53 
 
 
540 aa  189  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1783  chemotaxis sensory transducer  41.19 
 
 
515 aa  188  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.552405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 
561 aa  187  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.77 
 
 
550 aa  187  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.37871  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.31 
 
 
545 aa  187  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.78 
 
 
560 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0163835  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.76 
 
 
397 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.362921  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.07 
 
 
574 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0260271  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.04 
 
 
567 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.54 
 
 
687 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  34.99 
 
 
565 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.31 
 
 
573 aa  184  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  28.35 
 
 
656 aa  184  6e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  44.49 
 
 
965 aa  183  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.58 
 
 
569 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2646  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.42 
 
 
625 aa  182  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.99 
 
 
731 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.74 
 
 
563 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.14 
 
 
554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47 
 
 
535 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79817  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.53 
 
 
493 aa  181  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3114  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.73 
 
 
667 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.02 
 
 
632 aa  180  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6950  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  31.03 
 
 
661 aa  180  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.78 
 
 
558 aa  180  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
563 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0210  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.9 
 
 
632 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  normal  0.150257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5515  chemotaxis sensory transducer  29.33 
 
 
658 aa  178  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501051  normal  0.584272 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.36 
 
 
544 aa  178  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6993  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  36.68 
 
 
697 aa  177  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.5 
 
 
586 aa  177  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>