More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3266 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  84.75 
 
 		 610 aa  989    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  71.29 
 
 		 606 aa  845    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  72.82 
 
 		 603 aa  875    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 607 aa  1203    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  73.93 
 
 		 598 aa  877    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  73.69 
 
 		 604 aa  881    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  72.02 
 
 		 601 aa  847    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  48.71 
 
 		 769 aa  542  1e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  48.46 
 
 		 769 aa  543  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  48.16 
 
 		 769 aa  543  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  47.56 
 
 		 783 aa  536  1e-151  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  47.87 
 
 		 785 aa  538  1e-151  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  48.06 
 
 		 770 aa  532  1e-150  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  46.39 
 
 		 770 aa  530  1e-149  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  46.41 
 
 		 774 aa  524  1e-147  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  47.86 
 
 		 770 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  45.13 
 
 		 803 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 652 aa  426  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  41.1 
 
 		 639 aa  420  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  51.3 
 
 		 681 aa  400  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  38.51 
 
 		 766 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 		 728 aa  396  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 878 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  36.92 
 
 		 801 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  41.44 
 
 		 742 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2222  chemotaxis protein CheA  49.87 
 
 		 692 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 730 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 1031 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 653 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 		 696 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  46.85 
 
 		 690 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 796 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  45.07 
 
 		 701 aa  385  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 760 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  37.99 
 
 		 888 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  47.04 
 
 		 745 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  48.32 
 
 		 666 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.25 
 
 		 942 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  49.1 
 
 		 695 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  51.03 
 
 		 729 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  50.65 
 
 		 677 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  48.7 
 
 		 660 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  49.87 
 
 		 1089 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  49.1 
 
 		 954 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  38.59 
 
 		 910 aa  376  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 		 934 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  46.53 
 
 		 675 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  47.44 
 
 		 697 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  51.03 
 
 		 685 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  37.48 
 
 		 935 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  43.95 
 
 		 767 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 911 aa  375  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  46.21 
 
 		 558 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  48.19 
 
 		 666 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  44.25 
 
 		 701 aa  372  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  45.89 
 
 		 686 aa  372  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  45.43 
 
 		 671 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2818  CheA signal transduction histidine kinases  35.54 
 
 		 602 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  45.9 
 
 		 713 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  47.27 
 
 		 673 aa  369  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  34.51 
 
 		 654 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  50.26 
 
 		 1030 aa  369  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  46.19 
 
 		 719 aa  369  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  48.83 
 
 		 715 aa  369  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 871 aa  369  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  44.24 
 
 		 709 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 921 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 654 aa  365  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  34.82 
 
 		 652 aa  365  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  50 
 
 		 692 aa  364  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  34.14 
 
 		 654 aa  364  3e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  34.14 
 
 		 654 aa  364  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  34.14 
 
 		 654 aa  364  3e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  34.51 
 
 		 652 aa  363  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  34.51 
 
 		 654 aa  363  4e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  48.2 
 
 		 691 aa  363  7.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  46.02 
 
 		 702 aa  363  7.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  47.51 
 
 		 748 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  47.77 
 
 		 743 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  44.69 
 
 		 688 aa  362  9e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  47.77 
 
 		 747 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  47.51 
 
 		 753 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 		 650 aa  361  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  46.85 
 
 		 674 aa  361  2e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  46.77 
 
 		 737 aa  361  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  42.64 
 
 		 751 aa  359  9e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  47.51 
 
 		 739 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  46.11 
 
 		 673 aa  358  9.999999999999999e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  47.24 
 
 		 747 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 		 691 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  47 
 
 		 655 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  46.23 
 
 		 671 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  34.48 
 
 		 598 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  42.56 
 
 		 754 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  48.18 
 
 		 614 aa  356  5e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 		 747 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 916 aa  356  7.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  41.7 
 
 		 736 aa  356  8.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  46.25 
 
 		 748 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  45.99 
 
 		 754 aa  355  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>