143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2583 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 734 aa  1488    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  32.74 
 
 		 1201 aa  337  5.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  32.7 
 
 		 1272 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  31.43 
 
 		 1736 aa  327  5e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  32.04 
 
 		 1430 aa  323  7e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  32.6 
 
 		 1363 aa  323  8e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  32.56 
 
 		 1363 aa  320  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  32.56 
 
 		 1380 aa  315  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  30.6 
 
 		 625 aa  254  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  29.02 
 
 		 1247 aa  248  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  31.85 
 
 		 620 aa  244  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  32.21 
 
 		 1303 aa  242  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  30.13 
 
 		 708 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  31.51 
 
 		 625 aa  227  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  29.6 
 
 		 647 aa  227  7e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  33.71 
 
 		 1973 aa  226  8e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  31.25 
 
 		 1601 aa  220  7.999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  30.4 
 
 		 631 aa  213  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  29.99 
 
 		 523 aa  210  6e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  29.96 
 
 		 677 aa  205  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  28.55 
 
 		 661 aa  204  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  28.16 
 
 		 840 aa  196  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  29.2 
 
 		 706 aa  195  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  27.89 
 
 		 698 aa  195  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  28.18 
 
 		 779 aa  193  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  30.06 
 
 		 676 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  30.24 
 
 		 1094 aa  189  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  26.65 
 
 		 798 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  27.1 
 
 		 799 aa  187  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  28.95 
 
 		 872 aa  187  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  26.9 
 
 		 798 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  34.69 
 
 		 1308 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  27.12 
 
 		 779 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  28.88 
 
 		 1248 aa  158  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  25.43 
 
 		 647 aa  153  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  27.84 
 
 		 643 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  29.82 
 
 		 687 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  32.85 
 
 		 1299 aa  134  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  32.85 
 
 		 1299 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  24.97 
 
 		 536 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  25.99 
 
 		 628 aa  120  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  24.3 
 
 		 679 aa  117  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  24.39 
 
 		 536 aa  114  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  26.38 
 
 		 508 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  23.94 
 
 		 496 aa  108  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  26.81 
 
 		 528 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  25 
 
 		 486 aa  98.6  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  23.21 
 
 		 569 aa  94.4  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  24.28 
 
 		 547 aa  94.4  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  26.17 
 
 		 487 aa  87.4  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  25.06 
 
 		 515 aa  85.5  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  24.16 
 
 		 527 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  24.55 
 
 		 528 aa  79.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  26.46 
 
 		 512 aa  79.7  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  24.25 
 
 		 760 aa  78.2  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  21.96 
 
 		 532 aa  78.2  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  28.52 
 
 		 570 aa  75.9  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  23.65 
 
 		 645 aa  74.7  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  22.74 
 
 		 536 aa  74.3  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  26.9 
 
 		 502 aa  73.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  26.9 
 
 		 502 aa  73.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  23.06 
 
 		 524 aa  73.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  21.82 
 
 		 505 aa  72  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  28.11 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  24.53 
 
 		 534 aa  70.1  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  27.5 
 
 		 542 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  24.53 
 
 		 534 aa  69.7  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  24.88 
 
 		 506 aa  68.6  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  24.21 
 
 		 533 aa  67.8  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  22.02 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  24.76 
 
 		 536 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  24.76 
 
 		 536 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  20.26 
 
 		 538 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  20.12 
 
 		 516 aa  65.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0069  Bilirubin oxidase  23.42 
 
 		 603 aa  65.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  24.45 
 
 		 536 aa  65.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  24.45 
 
 		 536 aa  65.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  24.47 
 
 		 551 aa  64.3  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2196  multicopper oxidase  23.48 
 
 		 556 aa  63.9  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3523  repressor protein for FtsI  22.8 
 
 		 470 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3422  repressor protein for FtsI  22.8 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3358  repressor protein for FtsI  22.8 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.246662 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3353  repressor protein for FtsI  22.8 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3428  repressor protein for FtsI  22.8 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  25.96 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  22.58 
 
 		 470 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1178  multicopper oxidase type 3  23.58 
 
 		 575 aa  60.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  22.58 
 
 		 470 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3485  repressor protein for FtsI  22.58 
 
 		 470 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4297  Bilirubin oxidase  23.25 
 
 		 877 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  25.96 
 
 		 533 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02839  hypothetical protein  22.58 
 
 		 470 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  25.96 
 
 		 533 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  22.58 
 
 		 470 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3308  repressor protein for FtsI  22.58 
 
 		 470 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  0.0130524 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3454  repressor protein for FtsI  22.58 
 
 		 470 aa  60.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4328  repressor protein for FtsI  22.58 
 
 		 470 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  26.95 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  24.26 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  24.19 
 
 		 516 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>