More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2709 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  100 
 
 
311 aa  627  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  67.95 
 
 
312 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  55.23 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  50 
 
 
310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  51.14 
 
 
303 aa  299  5e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  51.47 
 
 
303 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  51.47 
 
 
303 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  48.21 
 
 
294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  46.71 
 
 
299 aa  263  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  50.17 
 
 
288 aa  263  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  47.06 
 
 
294 aa  264  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  46.58 
 
 
307 aa  263  3e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  46.89 
 
 
294 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  46.15 
 
 
308 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  41.99 
 
 
313 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  44.41 
 
 
308 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  45.45 
 
 
294 aa  260  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  45.43 
 
 
308 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  47.23 
 
 
295 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  45.57 
 
 
308 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  45.83 
 
 
308 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  46.58 
 
 
295 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  46.58 
 
 
295 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  45.57 
 
 
308 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  45.78 
 
 
292 aa  257  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  46.2 
 
 
312 aa  257  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  46.25 
 
 
295 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  46.25 
 
 
295 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  46.25 
 
 
295 aa  256  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  46.25 
 
 
295 aa  256  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  46.25 
 
 
295 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  46.25 
 
 
295 aa  256  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  41.21 
 
 
314 aa  255  5e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  48.51 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  45.93 
 
 
295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  46.89 
 
 
310 aa  251  8.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  49.03 
 
 
307 aa  251  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  44.16 
 
 
307 aa  249  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  45.9 
 
 
305 aa  249  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  45.9 
 
 
305 aa  249  5e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  47.57 
 
 
309 aa  247  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  44.16 
 
 
307 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  44.63 
 
 
295 aa  246  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  44.44 
 
 
291 aa  246  4e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  44.52 
 
 
287 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  46.35 
 
 
301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  42.72 
 
 
300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  44.41 
 
 
292 aa  242  6e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  45.1 
 
 
293 aa  242  7e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  43.65 
 
 
291 aa  241  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  47.59 
 
 
286 aa  240  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  44.44 
 
 
308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  47.92 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  46.13 
 
 
296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  43.04 
 
 
293 aa  239  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  43 
 
 
286 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  45.25 
 
 
308 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  45.78 
 
 
289 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  45.19 
 
 
307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0839  elongation factor Ts  37.43 
 
 
352 aa  235  6e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0656173  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  47.85 
 
 
301 aa  235  6e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  43.97 
 
 
292 aa  235  9e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1261  elongation factor Ts  38.72 
 
 
354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00427037  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1441  elongation factor Ts  39.33 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  49.66 
 
 
288 aa  232  5e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  44.03 
 
 
286 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  42.81 
 
 
276 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  41.51 
 
 
312 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0550  elongation factor Ts  38.35 
 
 
348 aa  229  4e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00242368  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  43.42 
 
 
292 aa  229  5e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  44.55 
 
 
307 aa  229  5e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  43.09 
 
 
292 aa  228  7e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  43.14 
 
 
293 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  44.82 
 
 
293 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  47.5 
 
 
308 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  45.15 
 
 
293 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  43.14 
 
 
293 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  42.27 
 
 
276 aa  227  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  41.23 
 
 
310 aa  227  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  39.31 
 
 
288 aa  227  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  44.48 
 
 
293 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  44.48 
 
 
293 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  44.48 
 
 
293 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  42.95 
 
 
296 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  43.15 
 
 
267 aa  224  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  44.48 
 
 
293 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  42.95 
 
 
296 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  44.48 
 
 
293 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  43.13 
 
 
291 aa  224  1e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  44.48 
 
 
293 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  44.48 
 
 
294 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  46.77 
 
 
291 aa  223  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  43.81 
 
 
290 aa  224  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  44.48 
 
 
293 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  45.15 
 
 
293 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  47.1 
 
 
306 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  43.81 
 
 
293 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  43.81 
 
 
293 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  43.81 
 
 
293 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  44.41 
 
 
291 aa  223  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>