More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2607 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 122 aa  243  6e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  74.77 
 
 		 129 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  68.75 
 
 		 128 aa  144  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  65.26 
 
 		 134 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  64.21 
 
 		 134 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  64.58 
 
 		 118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  62.37 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  46.15 
 
 		 147 aa  97.4  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  41.82 
 
 		 168 aa  87.8  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  37.9 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2024  30S ribosomal protein S6  40.2 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.359562  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  40.38 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  39.8 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  40.38 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  40.82 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  42.86 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 95 aa  83.6  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  40.82 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  40.82 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  41.76 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  34.43 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  34.4 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  34.43 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  34.91 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  39.58 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  32.8 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  38.54 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  39.33 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1830  ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  36.89 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0451  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000202528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  32.54 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2030  30S ribosomal protein S6  37.37 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  37.27 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  39.33 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  31.09 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  31.93 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  31.93 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1526  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153289  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  34.26 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  31.4 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0428  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.531029 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  31.4 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3351  30S ribosomal protein S6  33.64 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  38.2 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  38.2 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  32.35 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1350  30S ribosomal protein S6  35.35 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  31.63 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  32.35 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  34.44 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  33.04 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1057  30S ribosomal protein S6  31.82 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.66834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0574  ribosomal protein S6  29.09 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0794  30S ribosomal protein S6  30.91 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00576366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  30.91 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2462  SSU ribosomal protein S6P  38.38 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3639  30S ribosomal protein S6  30.91 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  32.76 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0683  30S ribosomal protein S6  30.91 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3784  30S ribosomal protein S6  30.91 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3482  30S ribosomal protein S6  35.24 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676473  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  36.73 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1438  30S ribosomal protein S6  32.14 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0054631  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3064  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.234735  normal  0.218428 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3435  30S ribosomal protein S6  30.91 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3592  30S ribosomal protein S6  30.91 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  30.91 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0515  30S ribosomal protein S6  32.73 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.38245  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  32.43 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>