More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1932 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  77.18 
 
 
416 aa  672  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  85.3 
 
 
415 aa  748  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  85.75 
 
 
415 aa  744  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  85.16 
 
 
413 aa  732  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  80.43 
 
 
415 aa  709  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  81.4 
 
 
415 aa  720  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  80.68 
 
 
415 aa  714  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
415 aa  858  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.67671e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  72.03 
 
 
412 aa  597  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  71.29 
 
 
412 aa  589  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  67.88 
 
 
412 aa  588  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  67.88 
 
 
412 aa  588  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  68.54 
 
 
411 aa  579  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  7.28494e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 
414 aa  579  1e-164  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  66.91 
 
 
418 aa  580  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  67.32 
 
 
410 aa  579  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  67.57 
 
 
410 aa  581  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  66.42 
 
 
412 aa  578  1e-164  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  72.21 
 
 
412 aa  575  1e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  67.8 
 
 
413 aa  575  1e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  3.58223e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  68.05 
 
 
413 aa  577  1e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  3.38182e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  66.83 
 
 
412 aa  577  1e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  67.48 
 
 
415 aa  577  1e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  67.8 
 
 
413 aa  575  1e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.15106e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  67.23 
 
 
413 aa  571  1e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  67.8 
 
 
413 aa  572  1e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  67.56 
 
 
413 aa  573  1e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.29833e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  66.34 
 
 
412 aa  571  1e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  67.81 
 
 
414 aa  573  1e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  67.56 
 
 
413 aa  573  1e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  68.06 
 
 
414 aa  574  1e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  4.68931e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  67.56 
 
 
413 aa  572  1e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  5.94889e-09  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  67.81 
 
 
414 aa  573  1e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  64.32 
 
 
412 aa  568  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  63.9 
 
 
414 aa  568  1e-161  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  66.58 
 
 
412 aa  570  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  64.72 
 
 
411 aa  565  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  65.36 
 
 
420 aa  565  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  66.1 
 
 
414 aa  562  1e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0064  serine hydroxymethyltransferase  68.61 
 
 
412 aa  561  1e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  65.44 
 
 
412 aa  561  1e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  63.72 
 
 
424 aa  559  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  64.96 
 
 
417 aa  558  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  68.22 
 
 
414 aa  559  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  65.32 
 
 
422 aa  556  1e-157  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 
417 aa  557  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.0982e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  64.23 
 
 
417 aa  556  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  65.45 
 
 
413 aa  555  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  64.48 
 
 
417 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  64.72 
 
 
417 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  64.48 
 
 
417 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  64.68 
 
 
427 aa  551  1e-156  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  63.75 
 
 
417 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  63.33 
 
 
417 aa  552  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 
415 aa  552  1e-156  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  63.5 
 
 
417 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  63.02 
 
 
417 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  64.68 
 
 
427 aa  551  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 
417 aa  545  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  63.26 
 
 
417 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  63.68 
 
 
420 aa  547  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  63.02 
 
 
417 aa  548  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  62.77 
 
 
417 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 
417 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  63.26 
 
 
417 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  63.02 
 
 
417 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  64.46 
 
 
419 aa  546  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  5.84892e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  63.02 
 
 
417 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  62.93 
 
 
417 aa  546  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 
412 aa  546  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  61.95 
 
 
417 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  65.2 
 
 
413 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  63.35 
 
 
419 aa  542  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 
417 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 
417 aa  544  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 
417 aa  543  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  61.95 
 
 
417 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  61.95 
 
 
417 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  64.02 
 
 
415 aa  540  1e-152  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  62.38 
 
 
422 aa  539  1e-152  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  63.26 
 
 
417 aa  539  1e-152  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  61.95 
 
 
417 aa  541  1e-152  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  61.71 
 
 
417 aa  539  1e-152  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  61.8 
 
 
417 aa  540  1e-152  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 
418 aa  534  1e-151  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  62.84 
 
 
417 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  60.83 
 
 
417 aa  534  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  63.41 
 
 
416 aa  537  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  60.83 
 
 
417 aa  535  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  61.71 
 
 
417 aa  536  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 
431 aa  536  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 
417 aa  535  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  63.7 
 
 
422 aa  533  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  62.65 
 
 
413 aa  532  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.12054e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  61.82 
 
 
417 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0345  serine hydroxymethyltransferase  61.58 
 
 
417 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.911009 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  61.33 
 
 
417 aa  531  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 
429 aa  528  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0344  serine hydroxymethyltransferase  61.58 
 
 
417 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  65.87 
 
 
415 aa  530  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>