More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0827 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0167  cytochrome c oxidase, subunit I  62.71 
 
 		 563 aa  693    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0110936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  63.65 
 
 		 563 aa  696    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  64.18 
 
 		 558 aa  707    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5816  cytochrome c oxidase, subunit I  62.45 
 
 		 558 aa  657    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099341  hitchhiker  0.00453601 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4436  cytochrome-c oxidase  66.28 
 
 		 545 aa  725    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0196071  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  62.57 
 
 		 535 aa  696    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  62.34 
 
 		 563 aa  692    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0827  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 		 540 aa  1074    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.541437  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6230  cytochrome c oxidase, subunit I  62.52 
 
 		 565 aa  673    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33684  normal  0.0324677 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4179  cytochrome c oxidase, subunit I  64.56 
 
 		 557 aa  679    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.263418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  64.12 
 
 		 544 aa  716    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6885  cytochrome c oxidase, subunit I  62.45 
 
 		 558 aa  661    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5947  cytochrome c oxidase, subunit I  63.65 
 
 		 554 aa  678    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  63.15 
 
 		 552 aa  695    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  65.21 
 
 		 548 aa  722    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  57.39 
 
 		 564 aa  595  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  56.84 
 
 		 542 aa  598  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  55.56 
 
 		 556 aa  582  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0849  cytochrome c oxidase subunit I type  54.28 
 
 		 555 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0230  cytochrome c oxidase, subunit I  57.12 
 
 		 565 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123434  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0852  cytochrome c oxidase, subunit I  55.28 
 
 		 554 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0804  cytochrome-c oxidase  55.28 
 
 		 554 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0856  cytochrome c oxidase, subunit I  55.28 
 
 		 554 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  53.07 
 
 		 541 aa  543  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2274  cytochrome-c oxidase  55.99 
 
 		 554 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.413145  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  51.51 
 
 		 539 aa  543  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0219  cytochrome c oxidase, subunit I  52.65 
 
 		 541 aa  536  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1677  cytochrome c oxidase, subunit I  55.99 
 
 		 555 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1601  cytochrome c oxidase, subunit I  55.99 
 
 		 555 aa  535  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171665  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0536  cytochrome c oxidase, subunit I  51.52 
 
 		 541 aa  531  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.091525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2705  Cytochrome-c oxidase  53.74 
 
 		 528 aa  528  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1345  cytochrome-c oxidase  51.71 
 
 		 541 aa  525  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0187504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2526  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit I  53 
 
 		 543 aa  519  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000123308  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  50.76 
 
 		 539 aa  513  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1823  cytochrome-c oxidase  51.52 
 
 		 543 aa  503  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200006  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  49.81 
 
 		 542 aa  502  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  45.33 
 
 		 587 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  45.83 
 
 		 560 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  44.47 
 
 		 590 aa  451  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  43.61 
 
 		 558 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  42.91 
 
 		 541 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  44.79 
 
 		 564 aa  447  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  46.36 
 
 		 641 aa  445  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  43.26 
 
 		 546 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  44.29 
 
 		 575 aa  444  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  47.17 
 
 		 641 aa  442  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  43.4 
 
 		 546 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  43.74 
 
 		 548 aa  442  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  45.78 
 
 		 615 aa  441  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  44.4 
 
 		 555 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  43.81 
 
 		 552 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  43.82 
 
 		 556 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  42.86 
 
 		 541 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  43.02 
 
 		 555 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  42.67 
 
 		 541 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  43.02 
 
 		 555 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  44.07 
 
 		 553 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  42.86 
 
 		 539 aa  438  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  44.95 
 
 		 559 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  42.48 
 
 		 541 aa  435  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  44.65 
 
 		 806 aa  432  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  45.91 
 
 		 796 aa  430  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  42.29 
 
 		 555 aa  428  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  41.24 
 
 		 555 aa  424  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  44.2 
 
 		 566 aa  422  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  42.1 
 
 		 565 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  41.67 
 
 		 559 aa  418  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  45 
 
 		 743 aa  416  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  40.69 
 
 		 562 aa  415  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  44.68 
 
 		 532 aa  414  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  41.28 
 
 		 554 aa  414  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  41.11 
 
 		 638 aa  414  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0984  cytochrome c oxidase, subunit I  42.72 
 
 		 619 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  43.36 
 
 		 974 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  41.06 
 
 		 553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  43.55 
 
 		 950 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  43.57 
 
 		 661 aa  408  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  43.55 
 
 		 962 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  45.14 
 
 		 541 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  42.41 
 
 		 555 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1960  cytochrome c oxidase, subunit I  42.2 
 
 		 561 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00322963  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  43.71 
 
 		 879 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  43.77 
 
 		 534 aa  404  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  43.71 
 
 		 882 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1290  cytochrome c oxidase, subunit I  42.41 
 
 		 564 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  44.01 
 
 		 530 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  42.99 
 
 		 879 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  42.99 
 
 		 879 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  42.39 
 
 		 561 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  42.75 
 
 		 594 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  41.36 
 
 		 563 aa  396  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  43.34 
 
 		 542 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  43.39 
 
 		 540 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6145  cytochrome c oxidase, subunit I  42.61 
 
 		 1004 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.440203 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5501  cytochrome c oxidase, subunit I  42.2 
 
 		 876 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0931338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  43.59 
 
 		 542 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5490  cytochrome c oxidase, subunit I  42.58 
 
 		 669 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  41.97 
 
 		 535 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0032  cytochrome c oxidase, subunit I  43.44 
 
 		 542 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.616804 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  41.76 
 
 		 519 aa  392  1e-108  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>