74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0082 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  100 
 
 		 210 aa  412  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5287  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  51.42 
 
 		 211 aa  206  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5199  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  51.42 
 
 		 211 aa  206  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5579  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  50.94 
 
 		 211 aa  203  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  38.74 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1550  hypothetical protein  38.07 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0342013 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1309  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN- binding  41.24 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.306682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  44.79 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  38.92 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2299  hypothetical protein  38.64 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13866  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4367  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  41.57 
 
 		 220 aa  117  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5990  hypothetical protein  42.37 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4542  hypothetical protein  42.71 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1397  hypothetical protein  40.11 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1479  hypothetical protein  40.11 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0989  hypothetical protein  40.11 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1072  hypothetical protein  40.11 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0134  hypothetical protein  40.11 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0514  hypothetical protein  40.11 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2303  Uvs039  40.11 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  35.57 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1692  hypothetical protein  39.55 
 
 		 239 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.41 
 
 		 241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  37.22 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3056  hypothetical protein  41.82 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  35.87 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3402  hypothetical protein  40.61 
 
 		 227 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278918 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3120  hypothetical protein  40.31 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0647  flavin-nucleotide-binding protein  39.89 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1256  hypothetical protein  42.86 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1192  hypothetical protein  32.62 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0972272  normal  0.237635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1567  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  41.57 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.612765 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3004  hypothetical protein  41.44 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  38.73 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2201  flavin-nucleotide-binding protein  33.98 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3638  flavin-nucleotide-binding protein  34.55 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3889  flavin-nucleotide-binding protein  34.55 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3467  hypothetical protein  39.89 
 
 		 228 aa  99  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0244411  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000555  predicted flavin-nucleotide-binding protein  32.37 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5541  hypothetical protein  34.48 
 
 		 220 aa  98.6  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.418646 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3493  hypothetical protein  35.75 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  35.94 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4477  flavin-nucleotide-binding protein  34.27 
 
 		 189 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05333  hypothetical protein  31.55 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  29.8 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1909  hypothetical protein  33.51 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  35.45 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2952  hypothetical protein  27.66 
 
 		 199 aa  85.9  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3754  hypothetical protein  32.35 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  31.18 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2142  hypothetical protein  37.02 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0086  hypothetical protein  28.97 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2966  flavin-nucleotide-binding protein-like  37.41 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.840561 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01781  conserved hypothetical protein  31.76 
 
 		 266 aa  64.7  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345274 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2731  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  30.9 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.560885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0247  LexA DNA-binding domain protein  30.56 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.41 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1407  nitroimidazole resistance protein, putative  26.06 
 
 		 178 aa  49.3  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  26.67 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3517  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.6 
 
 		 154 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0426327  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1620  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.5 
 
 		 156 aa  46.6  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1163  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.74 
 
 		 157 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00783233  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1007  hypothetical protein  27.34 
 
 		 154 aa  45.4  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.596538 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1156  nitroimidazole resistance protein, putative  21.95 
 
 		 164 aa  45.1  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2063  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.91 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20286 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0078  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.42 
 
 		 158 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1806  nitroimidazole resistance protein, putative  32.84 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000286648  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  26.55 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1739  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25 
 
 		 163 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044515  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20760  predicted flavin-nucleotide-binding protein  24.22 
 
 		 167 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.45 
 
 		 182 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.71 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.67 
 
 		 157 aa  42.4  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988174  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  26.28 
 
 		 153 aa  42  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>