More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0185 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  60.91 
 
 		 751 aa  882    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  97.34 
 
 		 752 aa  1489    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  47.95 
 
 		 732 aa  658    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  60.61 
 
 		 746 aa  910    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  58.74 
 
 		 758 aa  887    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  66.36 
 
 		 754 aa  1000    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  100 
 
 		 752 aa  1526    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  57.98 
 
 		 744 aa  835    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  39.4 
 
 		 745 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  41.59 
 
 		 858 aa  568  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  38.73 
 
 		 732 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  37.12 
 
 		 815 aa  559  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  40.83 
 
 		 747 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  36.93 
 
 		 801 aa  546  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  36.8 
 
 		 801 aa  547  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  37.42 
 
 		 802 aa  543  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  38.4 
 
 		 804 aa  545  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  36.5 
 
 		 801 aa  543  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  38.55 
 
 		 809 aa  545  1e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  36.38 
 
 		 801 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  36.8 
 
 		 801 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  38.22 
 
 		 798 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  36.55 
 
 		 801 aa  538  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  36.55 
 
 		 801 aa  537  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  36.55 
 
 		 801 aa  538  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  36.55 
 
 		 801 aa  537  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  37.31 
 
 		 801 aa  537  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  36.55 
 
 		 801 aa  538  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  38.96 
 
 		 801 aa  538  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  35.73 
 
 		 818 aa  534  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  41.22 
 
 		 738 aa  531  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  41.78 
 
 		 735 aa  526  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0770  primosomal protein N'  44.49 
 
 		 735 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.654251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  37.41 
 
 		 781 aa  520  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  38.9 
 
 		 731 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  42.18 
 
 		 739 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  37.61 
 
 		 796 aa  513  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  44.09 
 
 		 798 aa  513  1e-144  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  38.66 
 
 		 732 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  38.62 
 
 		 731 aa  509  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  43.8 
 
 		 802 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  43.8 
 
 		 802 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  49.36 
 
 		 679 aa  509  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  41.64 
 
 		 739 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0764  primosomal protein N'  42.91 
 
 		 736 aa  505  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  38.87 
 
 		 768 aa  500  1e-140  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0764  primosomal protein N'  42.78 
 
 		 736 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129915  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0727  replication restart DNA helicase PriA  42.91 
 
 		 736 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.539418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  45.08 
 
 		 813 aa  499  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  47.07 
 
 		 803 aa  499  1e-140  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  40.21 
 
 		 730 aa  497  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  39.37 
 
 		 835 aa  498  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  39.37 
 
 		 738 aa  498  1e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  36.15 
 
 		 749 aa  493  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  39.92 
 
 		 743 aa  490  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0028  primosome assembly protein PriA  38.63 
 
 		 736 aa  483  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  43.62 
 
 		 661 aa  482  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  44.54 
 
 		 828 aa  479  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  39.36 
 
 		 744 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  37.42 
 
 		 774 aa  480  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  36.1 
 
 		 775 aa  480  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0603  primosome assembly protein PriA  40.31 
 
 		 740 aa  479  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  42.97 
 
 		 868 aa  479  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  36.14 
 
 		 914 aa  480  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  38.65 
 
 		 739 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  38.56 
 
 		 739 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  38.86 
 
 		 739 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  38.51 
 
 		 739 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  36.54 
 
 		 730 aa  477  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  37.09 
 
 		 835 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  38.51 
 
 		 739 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  40.9 
 
 		 739 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  44.5 
 
 		 866 aa  475  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  37.32 
 
 		 745 aa  472  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  38.57 
 
 		 746 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  37.65 
 
 		 815 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  36.61 
 
 		 843 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3356  primosomal protein N'  37.88 
 
 		 734 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  43.33 
 
 		 848 aa  466  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  42.58 
 
 		 803 aa  468  9.999999999999999e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  38.32 
 
 		 731 aa  464  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  43.49 
 
 		 815 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  42.5 
 
 		 738 aa  462  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  38.63 
 
 		 780 aa  465  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  41.48 
 
 		 802 aa  465  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  39.42 
 
 		 733 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  37.93 
 
 		 734 aa  462  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  35.66 
 
 		 733 aa  462  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4189  primosomal protein N'  36.94 
 
 		 725 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03820  primosome assembly protein PriA  38.16 
 
 		 732 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  38.16 
 
 		 732 aa  457  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  43 
 
 		 815 aa  459  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0499  primosomal protein N'  37.98 
 
 		 731 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  38.16 
 
 		 732 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0183  primosome assembly protein PriA  37.81 
 
 		 732 aa  458  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3778  primosomal protein N'  36.84 
 
 		 731 aa  457  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3794  primosome assembly protein PriA  38.65 
 
 		 731 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0116  primosome assembly protein PriA  37.98 
 
 		 732 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4099  primosome assembly protein PriA  37.98 
 
 		 732 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  35.53 
 
 		 733 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>