235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1827 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
309 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  50.33 
 
 
322 aa  269  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  47.52 
 
 
321 aa  269  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  49.35 
 
 
322 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  49.5 
 
 
322 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  50 
 
 
322 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  47.85 
 
 
321 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  49.35 
 
 
322 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  49.35 
 
 
322 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  49.35 
 
 
322 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  49.35 
 
 
322 aa  246  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  40.65 
 
 
310 aa  229  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  40.33 
 
 
308 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  40.33 
 
 
308 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  40 
 
 
308 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  40.33 
 
 
308 aa  228  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  40.32 
 
 
308 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  40 
 
 
308 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  39.46 
 
 
308 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  38.71 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  38.69 
 
 
308 aa  219  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.18 
 
 
313 aa  216  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.06 
 
 
303 aa  210  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2557  hypothetical protein  45.09 
 
 
320 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2610  hypothetical protein  45.09 
 
 
320 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  42.32 
 
 
297 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  39.38 
 
 
306 aa  201  9e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.77 
 
 
314 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1569  DMT family permease  35.25 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  32.35 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  32.12 
 
 
300 aa  160  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  33.11 
 
 
299 aa  159  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  33.68 
 
 
309 aa  159  6e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  35.59 
 
 
307 aa  159  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  35.33 
 
 
307 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  35 
 
 
307 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  35 
 
 
307 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  35 
 
 
307 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  35 
 
 
307 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  35 
 
 
307 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.22 
 
 
315 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  35.35 
 
 
299 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.22 
 
 
315 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.22 
 
 
315 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.22 
 
 
315 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.22 
 
 
315 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.63 
 
 
530 aa  155  7e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  31.53 
 
 
299 aa  155  8e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.67 
 
 
307 aa  155  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 
520 aa  152  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  31.31 
 
 
300 aa  151  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.89 
 
 
301 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  31.4 
 
 
296 aa  151  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  33.92 
 
 
297 aa  144  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  29.37 
 
 
305 aa  142  7e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1293  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.39 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.07 
 
 
293 aa  138  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  31.19 
 
 
304 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  28.19 
 
 
296 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  32.99 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26320  predicted permease, DMT superfamily  27.81 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  27.61 
 
 
290 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  27.27 
 
 
290 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0621  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.5 
 
 
310 aa  120  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0929157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  28.95 
 
 
315 aa  119  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.16 
 
 
310 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0379  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 
321 aa  116  6e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.234172  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11190  membrane protein  26.43 
 
 
325 aa  115  8.999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.720311 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1176  hypothetical protein  27.21 
 
 
358 aa  109  7.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.640658 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.1 
 
 
309 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  28.57 
 
 
308 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  28.09 
 
 
357 aa  75.9  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  26.71 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.58 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 
341 aa  68.9  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  24.26 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  27.94 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  26.81 
 
 
289 aa  67  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  24.33 
 
 
324 aa  64.3  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.35 
 
 
301 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  23.32 
 
 
327 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  26.43 
 
 
359 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  26.43 
 
 
359 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.25 
 
 
289 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  29.44 
 
 
305 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  25.82 
 
 
308 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  26.13 
 
 
359 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.66 
 
 
321 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  22.65 
 
 
301 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  23.18 
 
 
294 aa  59.3  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  23.29 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  22.79 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  23.45 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  22.79 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  23.15 
 
 
299 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  21.71 
 
 
294 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  22.79 
 
 
303 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  22.79 
 
 
303 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>