More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3144 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  813    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1435  SAM-dependent methyltransferase-like protein  74.3 
 
 		 401 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112315  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1538  SAM-dependent methyltransferase-like protein  72.91 
 
 		 399 aa  570  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37561e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2702  SAM-dependent methyltransferase-like protein  72.41 
 
 		 399 aa  567  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000137033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3504  SAM-dependent methyltransferase-like protein  71.32 
 
 		 398 aa  561  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00331784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  70.07 
 
 		 409 aa  553  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1068  SAM-dependent methyltransferases  67.01 
 
 		 398 aa  541  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000202436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  37.95 
 
 		 408 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  36.67 
 
 		 400 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  36.41 
 
 		 400 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  36.15 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  37.5 
 
 		 400 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4829  putative RNA methylase  37.82 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  30.45 
 
 		 389 aa  216  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  34.46 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  33.42 
 
 		 396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  33.42 
 
 		 396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  32.41 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  30.91 
 
 		 393 aa  212  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  36.64 
 
 		 392 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  33.16 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  33.87 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  33.16 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  33.16 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  33.07 
 
 		 396 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  33.07 
 
 		 396 aa  210  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  33.07 
 
 		 396 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  33.16 
 
 		 396 aa  209  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  31.52 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  32.63 
 
 		 396 aa  206  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0619  hypothetical protein  37.22 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  33.51 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3799  SAM-dependent methyltransferase  36.13 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  32.8 
 
 		 403 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  31.95 
 
 		 393 aa  203  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  36.41 
 
 		 402 aa  202  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  34.11 
 
 		 397 aa  202  8e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  32.53 
 
 		 403 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  32.53 
 
 		 403 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  32.53 
 
 		 403 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  32.53 
 
 		 403 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  34.17 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  32.81 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  34.17 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  34.22 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  30.17 
 
 		 399 aa  201  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  32.12 
 
 		 391 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  31.39 
 
 		 397 aa  199  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  32.73 
 
 		 394 aa  199  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  29.93 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  30.17 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  30.17 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  30.17 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  33.25 
 
 		 418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  32.28 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  32 
 
 		 395 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  29.93 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  34.91 
 
 		 412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  29.93 
 
 		 399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  31.01 
 
 		 394 aa  196  6e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  29.68 
 
 		 399 aa  196  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  29.68 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  31.12 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  29.68 
 
 		 399 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3236  PUA domain-containing protein  29.7 
 
 		 399 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.553903  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  32.56 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  30.59 
 
 		 397 aa  194  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  29.87 
 
 		 394 aa  193  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  31.11 
 
 		 391 aa  192  7e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  33.07 
 
 		 396 aa  192  8e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3242  SAM-dependent methyltransferase  35.06 
 
 		 397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  30.91 
 
 		 393 aa  190  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  30.96 
 
 		 394 aa  189  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  30.38 
 
 		 389 aa  189  8e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  34.01 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  29.79 
 
 		 415 aa  186  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  30.9 
 
 		 479 aa  186  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3685  SAM-dependent methyltransferase  33.93 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  33.25 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969032 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  33.59 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  31.92 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  31.67 
 
 		 409 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0614  SAM-dependent methyltransferase  32.4 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2995  SAM-dependent methyltransferase  33.59 
 
 		 395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46093  predicted protein  39.93 
 
 		 839 aa  181  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 397 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  33.08 
 
 		 404 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  35.62 
 
 		 407 aa  179  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  32.49 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  32.83 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0528  methyltransferase  32.82 
 
 		 398 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000817153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  29.59 
 
 		 395 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  35.26 
 
 		 407 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  33.42 
 
 		 400 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  30.39 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  28.68 
 
 		 411 aa  176  7e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  31.89 
 
 		 425 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  29.43 
 
 		 391 aa  176  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  32.2 
 
 		 396 aa  176  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  33.67 
 
 		 404 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>