More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1782 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
372 aa  778    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  97.85 
 
 
372 aa  766    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.64 
 
 
371 aa  588  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.58 
 
 
373 aa  579  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.1 
 
 
370 aa  578  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.92 
 
 
374 aa  560  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.89 
 
 
380 aa  532  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.62 
 
 
355 aa  508  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.93 
 
 
375 aa  495  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.88 
 
 
373 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.9 
 
 
373 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.86 
 
 
374 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.34 
 
 
370 aa  471  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.47 
 
 
373 aa  471  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.84 
 
 
369 aa  472  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.92 
 
 
379 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.32 
 
 
370 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.92 
 
 
379 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.2 
 
 
379 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.88 
 
 
395 aa  464  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.38 
 
 
379 aa  461  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.92 
 
 
379 aa  464  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.14 
 
 
370 aa  461  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.92 
 
 
379 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.92 
 
 
379 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.92 
 
 
379 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.92 
 
 
379 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.92 
 
 
379 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.97 
 
 
372 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.9 
 
 
373 aa  462  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.92 
 
 
379 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.06 
 
 
371 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.85 
 
 
380 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.81 
 
 
380 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.38 
 
 
379 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.01 
 
 
369 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.38 
 
 
379 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.56 
 
 
379 aa  449  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.79 
 
 
367 aa  451  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.31 
 
 
382 aa  450  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.09 
 
 
386 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.38 
 
 
379 aa  449  1e-125  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.02 
 
 
379 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.63 
 
 
380 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.14 
 
 
394 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3407  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.77 
 
 
370 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38542  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.96 
 
 
368 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.67 
 
 
377 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.04 
 
 
382 aa  440  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.97 
 
 
380 aa  436  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.83 
 
 
369 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.18 
 
 
371 aa  435  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1215  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.08 
 
 
385 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.557932 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  56.28 
 
 
371 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.49 
 
 
370 aa  432  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.14 
 
 
392 aa  432  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.92 
 
 
372 aa  433  1e-120  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.99 
 
 
371 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.67 
 
 
407 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.99 
 
 
371 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.75 
 
 
374 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.44 
 
 
370 aa  431  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.42 
 
 
375 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.69 
 
 
357 aa  428  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1156  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.44 
 
 
388 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10772  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.28 
 
 
391 aa  429  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3520  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.89 
 
 
377 aa  428  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1241  normal  0.323798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.68 
 
 
384 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.97 
 
 
392 aa  428  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2804  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.62 
 
 
376 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1495  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.89 
 
 
376 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.98 
 
 
374 aa  424  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0280  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.28 
 
 
375 aa  425  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.31 
 
 
377 aa  425  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.28 
 
 
372 aa  425  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.45 
 
 
374 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.45 
 
 
374 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.45 
 
 
374 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.17 
 
 
392 aa  424  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0833  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.07 
 
 
371 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  0.0233256 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3113  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.11 
 
 
374 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1570  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.45 
 
 
374 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000109087  hitchhiker  0.000000108069 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2346  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.32 
 
 
376 aa  421  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.395355  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.46 
 
 
368 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2520  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.09 
 
 
376 aa  422  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783169  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.86 
 
 
387 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1290  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.16 
 
 
375 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.87 
 
 
392 aa  422  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2882  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.45 
 
 
374 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000363226  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2807  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.45 
 
 
374 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.62 
 
 
370 aa  423  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.18 
 
 
379 aa  423  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2787  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.45 
 
 
374 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000135544  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.37 
 
 
374 aa  421  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000654614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.31 
 
 
381 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14600  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.34 
 
 
372 aa  421  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0863  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.07 
 
 
377 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.15 
 
 
377 aa  421  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.18 
 
 
374 aa  421  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000574895  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.16 
 
 
383 aa  423  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>