173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2026 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2026  NUDIX hydrolase  100 
 
 
152 aa  298  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0458229  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0099  NUDIX hydrolase  42.66 
 
 
291 aa  101  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25510  ADP-ribose pyrophosphatase  43.71 
 
 
165 aa  97.1  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0162353  normal  0.120334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2308  NUDIX hydrolase  43.17 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000433057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0188  hypothetical protein  39.86 
 
 
287 aa  91.3  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1033  NUDIX hydrolase  41.5 
 
 
161 aa  90.1  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.997989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1136  NUDIX hydrolase  44.22 
 
 
335 aa  87  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0533  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 
174 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0543  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 
174 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0555  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 
174 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51062  normal  0.852901 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2056  NUDIX hydrolase  45.07 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000128394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10418  mutator protein mutT3  39.47 
 
 
217 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0449167  normal  0.708231 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  37.16 
 
 
475 aa  84.3  6e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1010  NUDIX hydrolase  42.58 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0097  hypothetical protein  36.3 
 
 
299 aa  82  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4393  NUDIX hydrolase  41.78 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1609  Nucleotide-binding protein  37.67 
 
 
484 aa  79.7  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24850  ADP-ribose pyrophosphatase  41.61 
 
 
305 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203973  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5298  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0199  NUDIX hydrolase  40 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0837  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172365  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4360  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11563  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0706  NUDIX hydrolase  40.69 
 
 
179 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0747129 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3752  NUDIX hydrolase  38.13 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3604  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
292 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.763493  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  32.5 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4453  mutator mutT protein  30.65 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0347377  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.93 
 
 
133 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 
221 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 
221 aa  50.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  39.47 
 
 
319 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  33.33 
 
 
131 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  27.52 
 
 
126 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0176  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 
196 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0165  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 
196 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 
135 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2689  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
180 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.392631  normal  0.210374 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  31.25 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  34.62 
 
 
317 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0158  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 
196 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.226319  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3395  mutator mutT protein  26.12 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  27.52 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  30.51 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  34.31 
 
 
315 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  33.65 
 
 
313 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  30.51 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  51.56 
 
 
204 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  31.25 
 
 
317 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  54.9 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  32.18 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  31.9 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  30.83 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  29.9 
 
 
129 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  35.05 
 
 
315 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  38.46 
 
 
313 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.75 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  36.73 
 
 
314 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 
229 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  36.92 
 
 
316 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  48.21 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  32.26 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  30.3 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0412  NUDIX hydrolase  46 
 
 
174 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0161756  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  48.21 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  35.71 
 
 
314 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  33.61 
 
 
316 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 
167 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.75 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.75 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.75 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  31.58 
 
 
314 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  34.75 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  50 
 
 
324 aa  43.9  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.75 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  35.38 
 
 
316 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  27.27 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  33.68 
 
 
314 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  31.15 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  31.15 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  46.81 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>