More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1229 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  100 
 
 		 475 aa  979    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255715 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1609  Nucleotide-binding protein  61.8 
 
 		 484 aa  556  1e-157  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25510  ADP-ribose pyrophosphatase  58.18 
 
 		 165 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0162353  normal  0.120334 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1033  NUDIX hydrolase  51.57 
 
 		 161 aa  159  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.997989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3504  maf protein  53.33 
 
 		 203 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1041  maf protein  51.3 
 
 		 214 aa  152  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.407711  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21150  MAF protein  50 
 
 		 235 aa  150  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1571  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1140  maf protein  53.52 
 
 		 229 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25490  MAF protein  54.01 
 
 		 223 aa  146  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.124397  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7197  Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation-like protein  51.82 
 
 		 257 aa  146  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  0.0550333 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0846  maf protein  52.24 
 
 		 218 aa  145  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1010  NUDIX hydrolase  47.16 
 
 		 181 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1128  Maf-like protein  50.76 
 
 		 196 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1035  maf protein  48.61 
 
 		 221 aa  144  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.611513 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2443  maf protein  49.24 
 
 		 195 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0837  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 176 aa  139  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4892  Maf-like protein  49.62 
 
 		 195 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05870  Maf-like protein  45.65 
 
 		 223 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.538428 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1013  maf protein  50.74 
 
 		 232 aa  139  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.374037  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1318  maf protein  45.64 
 
 		 216 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2532  Maf-like protein  48.89 
 
 		 206 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3574  Maf-like protein  48.89 
 
 		 206 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0095  maf protein  50.76 
 
 		 197 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3911  maf protein  48.23 
 
 		 223 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.487608  normal  0.0561371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0836  Maf-like protein  50 
 
 		 197 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0679365  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0163  Maf-like protein  48.09 
 
 		 204 aa  137  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.74208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0823  maf protein  46.72 
 
 		 211 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.017605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1328  Maf-like protein  43.15 
 
 		 210 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1292  Maf-like protein  43.15 
 
 		 210 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.981627  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1272  maf protein  42.04 
 
 		 228 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1309  Maf-like protein  43.15 
 
 		 210 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114265 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1136  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0788  maf protein  47.01 
 
 		 199 aa  129  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.353227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4776  Maf-like protein  44.68 
 
 		 209 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.714834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1838  maf protein  46.67 
 
 		 209 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.244014  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08240  MAF protein  47.4 
 
 		 226 aa  128  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106558  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0097  hypothetical protein  43.42 
 
 		 299 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4232  maf protein  45.59 
 
 		 219 aa  124  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337108  normal  0.701882 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4360  NUDIX hydrolase  43.62 
 
 		 153 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6393  Maf-like protein  48.53 
 
 		 206 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0188  hypothetical protein  40.51 
 
 		 287 aa  120  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13311  Maf-like protein  41.01 
 
 		 222 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0794  maf protein  44.74 
 
 		 240 aa  118  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0145497 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2056  NUDIX hydrolase  44.16 
 
 		 165 aa  117  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000128394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1674  Maf-like protein  42.55 
 
 		 209 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4366  maf protein  41.91 
 
 		 202 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0851  maf protein  43.51 
 
 		 226 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05680  MAF protein  39.31 
 
 		 231 aa  113  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2308  NUDIX hydrolase  42.48 
 
 		 167 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000433057  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13361  Maf-like protein  48.41 
 
 		 203 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.377788  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13511  Maf-like protein  48.41 
 
 		 203 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467144  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1594  Maf-like protein  47.41 
 
 		 211 aa  110  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.697875  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13261  Maf-like protein  46.21 
 
 		 204 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0698999  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1258  maf protein  47.62 
 
 		 206 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.349097  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0209  Maf-like protein  49.09 
 
 		 208 aa  107  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24850  ADP-ribose pyrophosphatase  41.18 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0099  NUDIX hydrolase  37.34 
 
 		 291 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4393  NUDIX hydrolase  43.87 
 
 		 160 aa  107  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08381  Maf-like protein  47.01 
 
 		 186 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12351  Maf-like protein  38.82 
 
 		 214 aa  107  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0455202 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0768  maf protein  44.54 
 
 		 184 aa  106  8e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.120928 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5298  NUDIX hydrolase  41.77 
 
 		 170 aa  105  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3604  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 292 aa  103  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.763493  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3752  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 156 aa  100  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10418  mutator protein mutT3  37.87 
 
 		 217 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0449167  normal  0.708231 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2269  Maf-like protein  37.21 
 
 		 195 aa  95.9  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0543  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 174 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0555  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 174 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51062  normal  0.852901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0533  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 174 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0769  Maf-like protein  36.3 
 
 		 211 aa  93.6  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.91985  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1300  maf protein  31.11 
 
 		 199 aa  92.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.620785  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1607  maf protein  40.31 
 
 		 202 aa  91.3  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213904  normal  0.972679 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16091  Maf-like protein  36.3 
 
 		 211 aa  90.5  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.257914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1564  maf protein  30.53 
 
 		 229 aa  90.1  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0898  Maf-like protein  37.01 
 
 		 191 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0177  maf protein  34.96 
 
 		 189 aa  88.6  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0801823  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1652  Maf-like protein  38.4 
 
 		 197 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  36.36 
 
 		 197 aa  89  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2402  maf protein  39.67 
 
 		 204 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000551046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2269  Maf-like protein  35.16 
 
 		 199 aa  88.2  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  34.27 
 
 		 197 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1405  maf protein  28.26 
 
 		 193 aa  88.2  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000139135  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2564  maf protein  37.59 
 
 		 195 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  32.54 
 
 		 196 aa  87.4  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  34.27 
 
 		 197 aa  87  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  34.27 
 
 		 197 aa  87  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2112  Maf-like protein  31.36 
 
 		 192 aa  87  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  33.33 
 
 		 200 aa  86.7  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2565  maf protein  33.33 
 
 		 193 aa  86.7  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0535  maf protein  31.58 
 
 		 194 aa  86.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.997587 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2400  Maf-like protein  31.36 
 
 		 192 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1581  maf protein  33.6 
 
 		 195 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000404809  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2011  Maf-like protein  36.5 
 
 		 193 aa  85.5  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1634  maf protein  33.33 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  33.57 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  33.57 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  33.57 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  33.57 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  33.57 
 
 		 197 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  33.57 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>