137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24850 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_24850  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 
305 aa  594  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203973  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1136  NUDIX hydrolase  51.18 
 
 
335 aa  220  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0099  NUDIX hydrolase  46.39 
 
 
291 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3604  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 
292 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.763493  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0188  hypothetical protein  42.66 
 
 
287 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25510  ADP-ribose pyrophosphatase  53.69 
 
 
165 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0162353  normal  0.120334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2308  NUDIX hydrolase  49.31 
 
 
167 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000433057  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2056  NUDIX hydrolase  50 
 
 
165 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000128394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0097  hypothetical protein  35.34 
 
 
299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1609  Nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
484 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1010  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 
181 aa  125  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4360  NUDIX hydrolase  47.3 
 
 
153 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11563  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5298  NUDIX hydrolase  46.41 
 
 
170 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3752  NUDIX hydrolase  50 
 
 
156 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  41.18 
 
 
475 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255715 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0837  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 
176 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172365  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10418  mutator protein mutT3  47.06 
 
 
217 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0449167  normal  0.708231 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4393  NUDIX hydrolase  46.75 
 
 
160 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1033  NUDIX hydrolase  46.05 
 
 
161 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.997989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0199  NUDIX hydrolase  49.67 
 
 
180 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0543  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 
174 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0555  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 
174 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51062  normal  0.852901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0533  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 
174 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2787  hypothetical protein  52.27 
 
 
129 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.502157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0706  NUDIX hydrolase  50.67 
 
 
179 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0747129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3731  hypothetical protein  54.17 
 
 
132 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.612226  normal  0.022429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6968  hypothetical protein  51.56 
 
 
122 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.151467  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2307  hypothetical protein  50.78 
 
 
134 aa  86.7  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2155  hypothetical protein  52.54 
 
 
163 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995978  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2026  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 
152 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0458229  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3635  hypothetical protein  45.65 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1414  hypothetical protein  44.37 
 
 
137 aa  79  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234715  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3265  hypothetical protein  42.42 
 
 
122 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0757172  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3499  hypothetical protein  36.26 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.555316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1244  hypothetical protein  49.48 
 
 
197 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.214862  decreased coverage  0.000603891 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  44.04 
 
 
136 aa  57.4  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0833  hypothetical protein  43.8 
 
 
135 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.567086  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
334 aa  53.5  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  30.08 
 
 
129 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  25 
 
 
134 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  25 
 
 
134 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  30.94 
 
 
319 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14240  ADP-ribose pyrophosphatase  36.04 
 
 
182 aa  50.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12007  hypothetical protein  36.3 
 
 
135 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000940488  normal  0.526902 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4804  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 
188 aa  49.7  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.483514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 
157 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  35.61 
 
 
322 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1957  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  26.32 
 
 
137 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.892636  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0240  mutator mutT protein  26.32 
 
 
137 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.611039  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1033  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
542 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0906744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
252 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 
252 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  32.17 
 
 
134 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 
151 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  30.08 
 
 
132 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1997  hypothetical protein  37.82 
 
 
124 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  28.15 
 
 
152 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  30.77 
 
 
129 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  32.46 
 
 
317 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  24.59 
 
 
131 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2002  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.549907 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
175 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
525 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  33.6 
 
 
138 aa  46.6  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 
199 aa  46.6  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  33.6 
 
 
138 aa  46.6  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 
197 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
161 aa  46.2  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  29.37 
 
 
138 aa  46.2  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  28.77 
 
 
142 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  27.41 
 
 
154 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
120 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  27.48 
 
 
170 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 
240 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  29.32 
 
 
132 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  29.17 
 
 
164 aa  45.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 
153 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 
239 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 
239 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
130 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  31.15 
 
 
129 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
199 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1132  NUDIX family hydrolase  31.03 
 
 
157 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
157 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  29.27 
 
 
132 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
181 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  29.27 
 
 
137 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  25 
 
 
146 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  32.33 
 
 
135 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  30 
 
 
193 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  26.95 
 
 
306 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
204 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2016  hypothetical protein  36.97 
 
 
124 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  30.53 
 
 
132 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2062  hypothetical protein  36.97 
 
 
124 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
152 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
206 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  26.23 
 
 
134 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4225  NUDIX hydrolase  50 
 
 
186 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.827405  normal  0.0214287 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  27 
 
 
145 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>