More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1259 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  100 
 
 		 491 aa  938    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  69.71 
 
 		 450 aa  526  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  51.81 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  49.59 
 
 		 417 aa  335  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  43.96 
 
 		 450 aa  305  9.000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  46.75 
 
 		 461 aa  303  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  47.58 
 
 		 418 aa  297  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  45.98 
 
 		 442 aa  293  6e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  44.65 
 
 		 424 aa  287  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  45.94 
 
 		 441 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  42.48 
 
 		 413 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  41.46 
 
 		 457 aa  280  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  42.68 
 
 		 436 aa  279  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 		 456 aa  274  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  40.61 
 
 		 425 aa  269  8.999999999999999e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  43.13 
 
 		 452 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  39.89 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  41.64 
 
 		 405 aa  267  4e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  39.25 
 
 		 441 aa  266  5.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  40.96 
 
 		 419 aa  266  8e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  41.16 
 
 		 405 aa  263  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  43.78 
 
 		 419 aa  262  8.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 412 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  45.57 
 
 		 452 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  42.04 
 
 		 414 aa  258  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.9 
 
 		 446 aa  256  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 413 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 413 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 413 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 		 431 aa  252  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 		 428 aa  252  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  40.1 
 
 		 424 aa  251  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  41.24 
 
 		 426 aa  249  6e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 429 aa  248  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 446 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  42.62 
 
 		 403 aa  246  6.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  40.9 
 
 		 476 aa  246  8e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  42.23 
 
 		 418 aa  246  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  34.29 
 
 		 430 aa  244  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 418 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  41.64 
 
 		 416 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 		 432 aa  243  5e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  41.37 
 
 		 412 aa  242  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  41.78 
 
 		 426 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 416 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  38.6 
 
 		 441 aa  239  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  40.99 
 
 		 426 aa  238  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  37.64 
 
 		 474 aa  236  7e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  41.31 
 
 		 412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  35.94 
 
 		 446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  41.02 
 
 		 428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 418 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 		 404 aa  233  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 450 aa  232  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 509 aa  230  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  36.53 
 
 		 447 aa  229  9e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 		 433 aa  229  9e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  34.66 
 
 		 426 aa  228  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 		 421 aa  227  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  35.99 
 
 		 442 aa  226  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 418 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 		 453 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 		 494 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 417 aa  217  4e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  37.2 
 
 		 475 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  36.29 
 
 		 431 aa  213  7.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 474 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  37.95 
 
 		 413 aa  210  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 		 410 aa  210  6e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  34.27 
 
 		 424 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 406 aa  207  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 		 412 aa  206  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  39.48 
 
 		 378 aa  206  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 423 aa  202  9e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  36.71 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  29.1 
 
 		 403 aa  201  3e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 		 419 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  34.26 
 
 		 429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 		 432 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  31.69 
 
 		 410 aa  193  5e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 		 421 aa  193  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  35.2 
 
 		 429 aa  190  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0689  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.549457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  34.98 
 
 		 415 aa  187  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 413 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  37.69 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 426 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 413 aa  179  9e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 414 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  37.15 
 
 		 414 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>