More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2351 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  100 
 
 		 235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  87.3 
 
 		 189 aa  327  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  81.76 
 
 		 183 aa  279  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  72.78 
 
 		 186 aa  270  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  72.07 
 
 		 186 aa  264  7e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  70.95 
 
 		 201 aa  258  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  70.95 
 
 		 201 aa  258  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  69.27 
 
 		 186 aa  256  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  68.72 
 
 		 186 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  68.72 
 
 		 186 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  68.72 
 
 		 186 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  69.27 
 
 		 186 aa  254  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  70.39 
 
 		 205 aa  254  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  69.27 
 
 		 185 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  69.27 
 
 		 185 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  69.27 
 
 		 185 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  69.27 
 
 		 185 aa  253  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  69.27 
 
 		 185 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  67.6 
 
 		 186 aa  251  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  67.6 
 
 		 186 aa  251  7e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  68.68 
 
 		 188 aa  250  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  67.6 
 
 		 185 aa  248  5e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  67.03 
 
 		 188 aa  248  7e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  66.67 
 
 		 184 aa  246  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  66.11 
 
 		 186 aa  245  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  66.11 
 
 		 186 aa  245  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  62.92 
 
 		 188 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  61.29 
 
 		 191 aa  235  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  64.25 
 
 		 192 aa  235  6e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  63.19 
 
 		 200 aa  219  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  57.14 
 
 		 188 aa  217  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  62.15 
 
 		 184 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  59.89 
 
 		 187 aa  202  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  58.66 
 
 		 188 aa  191  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  58.1 
 
 		 188 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  53.04 
 
 		 192 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  72.22 
 
 		 129 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  51.41 
 
 		 187 aa  183  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  48.85 
 
 		 183 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  47.37 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  39.27 
 
 		 188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  39.56 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  40.11 
 
 		 189 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  42.16 
 
 		 182 aa  122  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  39.9 
 
 		 209 aa  121  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  46.53 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  39.9 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  41.08 
 
 		 218 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  46.53 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  42.29 
 
 		 186 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2319  resolvase, putative  49.62 
 
 		 137 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000512602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  40.11 
 
 		 190 aa  118  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  39.04 
 
 		 193 aa  118  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  39.56 
 
 		 197 aa  118  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  37.43 
 
 		 188 aa  118  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  39.56 
 
 		 197 aa  118  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  36.41 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  39.55 
 
 		 191 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  39.55 
 
 		 191 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  39.78 
 
 		 190 aa  115  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  37.37 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  39.34 
 
 		 184 aa  115  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  38.78 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  35.68 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  39.13 
 
 		 205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  38.89 
 
 		 196 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  36.92 
 
 		 190 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  36.92 
 
 		 190 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  36.92 
 
 		 190 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  38.3 
 
 		 203 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  37.84 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  37.84 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1647  resolvase domain protein  53.57 
 
 		 120 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 185 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  37.3 
 
 		 201 aa  112  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  37.23 
 
 		 185 aa  112  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  36.07 
 
 		 199 aa  112  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  37.43 
 
 		 197 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  35.75 
 
 		 189 aa  112  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  35.79 
 
 		 186 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  37.77 
 
 		 184 aa  111  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  36.7 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  37.43 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  36.7 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  40.64 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  35.98 
 
 		 184 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  36.14 
 
 		 200 aa  110  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  37.37 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  35.79 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  35.33 
 
 		 189 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  34.44 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  39.29 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  39.29 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  37.7 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  41.27 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  39.29 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  37.36 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>