71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2180 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  855    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  52.85 
 
 		 377 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  34.11 
 
 		 341 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  29.27 
 
 		 377 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  27.51 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  29.61 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  34.48 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  33.87 
 
 		 390 aa  126  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  27.8 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  27.8 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  28.62 
 
 		 470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  26.09 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  28.11 
 
 		 409 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  29.3 
 
 		 368 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2969  protein of unknown function DUF262  27.08 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.901235  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  30.37 
 
 		 345 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  28.02 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  26.76 
 
 		 349 aa  100  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  26.57 
 
 		 378 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  27.68 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  28.44 
 
 		 370 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  28.72 
 
 		 375 aa  94.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  29.15 
 
 		 394 aa  94.4  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  25.57 
 
 		 374 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  26.61 
 
 		 369 aa  93.2  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  24.38 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  29.6 
 
 		 539 aa  90.1  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  25.24 
 
 		 366 aa  90.1  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  28.57 
 
 		 406 aa  89.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  26.67 
 
 		 370 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  26.67 
 
 		 370 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  24.24 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  30.68 
 
 		 617 aa  85.9  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  25.27 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  25.17 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  27.05 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  24.73 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  33.33 
 
 		 458 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  28.18 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  27.55 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  26.94 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  25.75 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  27.23 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  31.09 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  28.7 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  25 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  27.84 
 
 		 638 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  26.48 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  25.76 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  32.35 
 
 		 363 aa  62  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  23.96 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  27.34 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  26.19 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  28.65 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  27.59 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  32.58 
 
 		 159 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  24.56 
 
 		 368 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  25 
 
 		 754 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  25 
 
 		 754 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  24.67 
 
 		 753 aa  50.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  42.86 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  23.5 
 
 		 576 aa  48.5  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  22.55 
 
 		 760 aa  47.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  41.51 
 
 		 375 aa  47.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  34.94 
 
 		 705 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1065  hypothetical protein  24.29 
 
 		 178 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  30.91 
 
 		 570 aa  43.9  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  23.03 
 
 		 589 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  24.38 
 
 		 657 aa  43.1  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  26.62 
 
 		 499 aa  43.1  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  26.72 
 
 		 539 aa  43.1  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>