More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0571 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 187 aa  358  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  87.06 
 
 		 182 aa  289  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  67.65 
 
 		 184 aa  229  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  65.29 
 
 		 174 aa  226  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  67.65 
 
 		 228 aa  224  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  65.12 
 
 		 181 aa  221  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  64.94 
 
 		 174 aa  221  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  67.65 
 
 		 174 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  65.88 
 
 		 174 aa  218  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  64.53 
 
 		 176 aa  217  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  66.27 
 
 		 200 aa  216  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  67.82 
 
 		 175 aa  215  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  66.28 
 
 		 181 aa  214  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  61.54 
 
 		 178 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  64.67 
 
 		 181 aa  209  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  63.31 
 
 		 202 aa  208  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0966  50S ribosomal protein L10  62.64 
 
 		 175 aa  207  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.968319  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0984  50S ribosomal protein L10  62.64 
 
 		 175 aa  207  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270382  normal  0.351336 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0750  ribosomal protein L10  64.37 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0994  50S ribosomal protein L10  62.07 
 
 		 175 aa  205  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  61.14 
 
 		 175 aa  204  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  62.57 
 
 		 175 aa  204  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4351  ribosomal protein L10  66.04 
 
 		 184 aa  203  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  59.41 
 
 		 172 aa  202  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  66.27 
 
 		 172 aa  200  9e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1252  50S ribosomal protein L10  62.13 
 
 		 179 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  62.87 
 
 		 178 aa  198  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  64.71 
 
 		 173 aa  198  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  58.2 
 
 		 203 aa  196  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5101  50S ribosomal protein L10  59.34 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0678  ribosomal protein L10  57.4 
 
 		 190 aa  195  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  62.72 
 
 		 173 aa  192  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  58.43 
 
 		 173 aa  192  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  63.91 
 
 		 212 aa  190  9e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  55.29 
 
 		 173 aa  180  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  51.76 
 
 		 173 aa  170  9e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2702  50S ribosomal protein L10  58.87 
 
 		 197 aa  162  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2990  50S ribosomal protein L10  58.16 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.302741  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  44.19 
 
 		 175 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  42.29 
 
 		 179 aa  135  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  44.71 
 
 		 174 aa  134  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  45.76 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  42.17 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  43.27 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  42.94 
 
 		 166 aa  124  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  39.66 
 
 		 181 aa  120  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  39.41 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  41.76 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  38.6 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  40.59 
 
 		 166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  40.59 
 
 		 166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  40.59 
 
 		 166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  40.59 
 
 		 166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  40.59 
 
 		 166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  40.59 
 
 		 166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  40.59 
 
 		 166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  40.59 
 
 		 166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  39.44 
 
 		 181 aa  118  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  42.31 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  40.59 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  40.23 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  42.26 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  42.94 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  45.18 
 
 		 256 aa  114  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  40.96 
 
 		 176 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  37.21 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  40.12 
 
 		 173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  39.08 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  40.12 
 
 		 173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  34.64 
 
 		 178 aa  111  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  40.96 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  40.96 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  37.95 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  44.44 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  38.51 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  36.47 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  38.07 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  38.69 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  40.72 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  38.32 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  37.93 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  32.2 
 
 		 180 aa  101  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  36.69 
 
 		 176 aa  100  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  40.54 
 
 		 178 aa  100  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 164 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  37.89 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  32.18 
 
 		 176 aa  98.6  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>