More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1146 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  100 
 
 
383 aa  778  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  63.95 
 
 
382 aa  456  1e-127  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  58.47 
 
 
373 aa  432  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  1.4932e-08 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  43.24 
 
 
389 aa  303  3e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.82 
 
 
320 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.54633e-15 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.06 
 
 
358 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  3.42072e-10 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.37 
 
 
320 aa  156  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.18 
 
 
335 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.91 
 
 
320 aa  152  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.90012e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.56 
 
 
324 aa  146  7e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  36.76 
 
 
321 aa  144  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.00228e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.01 
 
 
363 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5416  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.77 
 
 
373 aa  142  1e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.57 
 
 
363 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.02 
 
 
391 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.58 
 
 
737 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  34.43 
 
 
326 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.59 
 
 
326 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.15 
 
 
559 aa  136  7e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.45 
 
 
343 aa  135  1e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0610  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.81 
 
 
386 aa  135  1e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0430331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.29 
 
 
351 aa  134  2e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  28.84 
 
 
394 aa  134  2e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0366865  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.16 
 
 
354 aa  134  2e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_002950  PG1418  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  39.53 
 
 
602 aa  134  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.733892 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.94 
 
 
323 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1738  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  36.79 
 
 
605 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0751015  normal  0.0509359 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.76 
 
 
586 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.37 
 
 
327 aa  133  4e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.44 
 
 
562 aa  133  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.21 
 
 
561 aa  132  7e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.59056e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.7 
 
 
735 aa  132  8e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.44 
 
 
562 aa  132  8e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.33 
 
 
330 aa  132  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.32 
 
 
562 aa  132  1e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.3 
 
 
343 aa  132  1e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.32 
 
 
562 aa  132  1e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.32 
 
 
562 aa  132  1e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.77 
 
 
329 aa  132  1e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.44 
 
 
562 aa  132  1e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.44 
 
 
562 aa  132  1e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.32 
 
 
562 aa  132  1e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.32 
 
 
562 aa  131  2e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.86 
 
 
344 aa  131  2e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  2.88191e-06 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.32 
 
 
370 aa  131  2e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  36.2 
 
 
365 aa  130  4e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1961  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.51 
 
 
359 aa  130  4e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35780  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.83 
 
 
406 aa  130  4e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39309  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.82 
 
 
562 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  2.27385e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.44 
 
 
540 aa  129  7e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.74 
 
 
589 aa  129  9e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.93 
 
 
755 aa  129  1e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  40.59 
 
 
652 aa  128  1e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.33 
 
 
331 aa  128  1e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.41 
 
 
520 aa  129  1e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0828  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.01 
 
 
554 aa  128  1e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.79 
 
 
340 aa  128  2e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  41.67 
 
 
900 aa  127  2e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  31.1 
 
 
320 aa  128  2e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  25.99 
 
 
339 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.86 
 
 
550 aa  127  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 
625 aa  127  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.87 
 
 
517 aa  127  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.31 
 
 
588 aa  127  4e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.5496e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 
562 aa  127  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5180  DNA polymerase III subunit delta'  29.17 
 
 
402 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0809147 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40 
 
 
395 aa  126  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.32 
 
 
567 aa  126  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4880  DNA polymerase III subunit delta'  28.92 
 
 
402 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4794  DNA polymerase III subunit delta'  28.92 
 
 
402 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.671879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.7 
 
 
562 aa  126  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2074  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40 
 
 
648 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.81 
 
 
550 aa  125  8e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.82 
 
 
318 aa  125  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0606  DNA-directed DNA polymerase  30.71 
 
 
390 aa  125  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.063463  decreased coverage  0.0031746 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2118  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40 
 
 
650 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000251378  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.38 
 
 
611 aa  125  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0950425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.38 
 
 
427 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1396  DNA polymerase III subunit delta'  31.18 
 
 
404 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.305059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  32.13 
 
 
650 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2193  DNA-directed DNA polymerase  26.56 
 
 
385 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  37.36 
 
 
568 aa  125  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0389  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.31 
 
 
485 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.36 
 
 
467 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.51 
 
 
687 aa  125  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0213338 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.73 
 
 
695 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.92 
 
 
547 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  38.92 
 
 
807 aa  124  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  39.2 
 
 
330 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  38.19 
 
 
579 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.59 
 
 
522 aa  123  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0576  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.69 
 
 
378 aa  124  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200303 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.24 
 
 
565 aa  123  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4439  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.01 
 
 
730 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.54 
 
 
641 aa  123  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.196255 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2107  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.08 
 
 
534 aa  123  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00560473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.24 
 
 
565 aa  123  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.57 
 
 
320 aa  122  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0052  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.76 
 
 
547 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0055  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.76 
 
 
547 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>