More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2313 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  390  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 
188 aa  390  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 
188 aa  390  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 
188 aa  390  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 
188 aa  390  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 
188 aa  390  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  100 
 
 
188 aa  390  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  100 
 
 
188 aa  390  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 
188 aa  390  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  91.53 
 
 
189 aa  362  1e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  92.63 
 
 
190 aa  362  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.18421e-09 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  92.63 
 
 
190 aa  362  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  92.63 
 
 
190 aa  362  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  72.77 
 
 
191 aa  292  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  94.44 
 
 
147 aa  289  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.10623e-05 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  94.44 
 
 
147 aa  289  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  2.43067e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  71.05 
 
 
194 aa  283  1e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  69.47 
 
 
193 aa  278  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  67.57 
 
 
191 aa  275  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  68.62 
 
 
194 aa  275  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  68.62 
 
 
194 aa  275  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  69.73 
 
 
191 aa  258  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  66.87 
 
 
172 aa  236  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  57.14 
 
 
156 aa  160  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0391  NlpC/P60 family protein  43.39 
 
 
195 aa  151  4e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  41.04 
 
 
154 aa  145  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  52.38 
 
 
171 aa  144  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  40.8 
 
 
159 aa  143  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.56196e-07 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  40.8 
 
 
159 aa  143  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  4.1841e-08 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  40.8 
 
 
159 aa  143  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  43.03 
 
 
164 aa  140  1e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  43.71 
 
 
162 aa  140  1e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  47.1 
 
 
154 aa  140  1e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  47.1 
 
 
164 aa  139  2e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  47.1 
 
 
164 aa  139  2e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  44.38 
 
 
154 aa  139  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  48.36 
 
 
189 aa  139  4e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  40.72 
 
 
154 aa  138  5e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  43.29 
 
 
183 aa  138  5e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  50 
 
 
162 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  54.1 
 
 
155 aa  135  3e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  51.97 
 
 
154 aa  134  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  41.11 
 
 
157 aa  134  1e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1387  putative lipoprotein  44.68 
 
 
162 aa  132  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0376898  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  49.61 
 
 
154 aa  132  4e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  49.61 
 
 
143 aa  132  4e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  49.61 
 
 
154 aa  132  4e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  48.03 
 
 
154 aa  131  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  48.82 
 
 
154 aa  131  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  48.82 
 
 
154 aa  131  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  48.82 
 
 
154 aa  131  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  48.82 
 
 
154 aa  131  7e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  47.24 
 
 
154 aa  129  2e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  47.06 
 
 
150 aa  129  2e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  48.03 
 
 
154 aa  130  2e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  47.24 
 
 
154 aa  129  2e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  47.24 
 
 
154 aa  129  2e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  47.24 
 
 
154 aa  129  2e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  36.47 
 
 
167 aa  130  2e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  47.24 
 
 
154 aa  129  2e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.303201 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  48.03 
 
 
154 aa  129  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  48.03 
 
 
154 aa  129  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.468553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  48.03 
 
 
154 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  48.03 
 
 
154 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  36.78 
 
 
171 aa  129  4e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  47.75 
 
 
166 aa  128  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  47.46 
 
 
179 aa  127  1e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  46.15 
 
 
148 aa  126  2e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  49.15 
 
 
196 aa  126  2e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  8.56339e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  36.84 
 
 
205 aa  125  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  40.48 
 
 
211 aa  119  2e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  39.67 
 
 
203 aa  118  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0427  NLP/P60 protein  40.14 
 
 
240 aa  117  9e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0428  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
173 aa  117  1e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  35.38 
 
 
214 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  35 
 
 
226 aa  114  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  41.04 
 
 
173 aa  114  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0595  NLP/P60 protein  37.01 
 
 
201 aa  114  9e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  35.75 
 
 
205 aa  114  1e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  4.4472e-09 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  32.47 
 
 
205 aa  113  1e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
193 aa  113  2e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  39.47 
 
 
165 aa  113  2e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  44.54 
 
 
265 aa  112  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.04581e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  37.02 
 
 
193 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  52.29 
 
 
228 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  51.38 
 
 
226 aa  111  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  34.63 
 
 
214 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
215 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  42.37 
 
 
221 aa  110  1e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  41.45 
 
 
347 aa  110  1e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  6.88808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  43.9 
 
 
216 aa  109  2e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  37.78 
 
 
215 aa  110  2e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  37.57 
 
 
207 aa  110  2e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  35.23 
 
 
212 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  51.38 
 
 
150 aa  108  4e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  41.22 
 
 
232 aa  108  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1644  lipoprotein NlpC  42.54 
 
 
153 aa  108  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  50.46 
 
 
224 aa  108  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
346 aa  107  7e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
333 aa  108  7e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>