More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0028 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0028  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0008  Holliday junction endonuclease RuvC  73.08 
 
 		 156 aa  247  5e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0142  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.88 
 
 		 162 aa  156  9e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  34.39 
 
 		 181 aa  122  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  35.03 
 
 		 181 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  35.9 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  35.03 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.54 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.33 
 
 		 175 aa  120  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0681536  normal  0.335061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  37.84 
 
 		 169 aa  120  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  31.21 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  38.31 
 
 		 171 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2208  Holliday junction resolvase  37.18 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147946  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  35.76 
 
 		 181 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.53 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  34.44 
 
 		 181 aa  117  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  34.64 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  38.31 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  38.31 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0556  Holliday junction resolvase  36.94 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.657324  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.44 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  37.25 
 
 		 184 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0531  Holliday junction resolvase  36.08 
 
 		 183 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0004  Holliday junction resolvase  35.26 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000281167  normal  0.194479 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0955  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.46 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  33.99 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.6 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_002620  TC0789  Holliday junction resolvase  37.01 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00672819  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1211  Holliday junction resolvase  36.31 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.71 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  29.68 
 
 		 180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  35.53 
 
 		 168 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  35.9 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1647  Holliday junction resolvase  35.67 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0336  Holliday junction resolvase  37.18 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  32.72 
 
 		 180 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  33.99 
 
 		 172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3604  Holliday junction resolvase  36.77 
 
 		 169 aa  110  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.758164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  35.9 
 
 		 162 aa  110  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3179  Holliday junction resolvase  36.54 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1704  Holliday junction resolvase  35.67 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.723247  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  32.9 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  31.61 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  33.97 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1087  Holliday junction resolvase  35.26 
 
 		 169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109065  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  37.33 
 
 		 173 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  32.69 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  32.69 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  33.99 
 
 		 170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  37.59 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  32.69 
 
 		 180 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  32.69 
 
 		 180 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  32.05 
 
 		 180 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  32.05 
 
 		 180 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  32.05 
 
 		 180 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  32.05 
 
 		 180 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  32.26 
 
 		 173 aa  107  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3512  Holliday junction resolvase  35.03 
 
 		 169 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658473  normal  0.710668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  33.75 
 
 		 182 aa  107  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  32.69 
 
 		 180 aa  107  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  32.48 
 
 		 180 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  32.05 
 
 		 180 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  31.17 
 
 		 173 aa  107  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  32.52 
 
 		 186 aa  107  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  32.69 
 
 		 180 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2373  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 		 188 aa  107  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.511513 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  32.05 
 
 		 284 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  33.55 
 
 		 173 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0987  Holliday junction resolvase  30.07 
 
 		 166 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  32.05 
 
 		 275 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  32.05 
 
 		 180 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  32.47 
 
 		 182 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  31.9 
 
 		 186 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  33.77 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  33.77 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  34.42 
 
 		 182 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  31.45 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  33.77 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.6 
 
 		 187 aa  104  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0285  Holliday junction resolvase  33.85 
 
 		 189 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  30.77 
 
 		 180 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  30.77 
 
 		 180 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  32.9 
 
 		 173 aa  103  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  32.89 
 
 		 161 aa  103  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  31.82 
 
 		 179 aa  103  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  32.68 
 
 		 176 aa  103  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  31.45 
 
 		 182 aa  103  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  32.24 
 
 		 167 aa  102  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.19 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2639  Holliday junction resolvase  31.85 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  32.9 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  32.47 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0784  Holliday junction resolvase  35.76 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193363  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  32.9 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0926  Holliday junction resolvase  35.38 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.66838  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0962  Holliday junction resolvase  35.38 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00555421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  32.9 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  32.9 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  34.42 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2104  Holliday junction resolvase  36.84 
 
 		 159 aa  101  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>