More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0039 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  100 
 
 		 302 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  74.1 
 
 		 264 aa  378  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  73.25 
 
 		 261 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  69.17 
 
 		 257 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1057  ABC transporter related  64.2 
 
 		 298 aa  330  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.184914  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1961  ABC transporter related  54.69 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334641  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  53.04 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0669  ABC transporter related  52.63 
 
 		 254 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  51.36 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  56.61 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  53.85 
 
 		 259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1229  ABC transporter related  50.2 
 
 		 264 aa  255  7e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.380088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  50.2 
 
 		 252 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3497  ABC transporter related  53.28 
 
 		 256 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  48.13 
 
 		 265 aa  242  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1073  ABC transporter related  48.13 
 
 		 258 aa  242  7e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0467  ABC transporter related  52.28 
 
 		 253 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  50.21 
 
 		 267 aa  232  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3016  ABC transporter related  51.22 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  47.52 
 
 		 273 aa  208  7e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1016  ABC transporter-related protein  46.89 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  52.34 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  43.45 
 
 		 273 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  48.11 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  43.98 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  51.47 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  42.15 
 
 		 256 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  40.25 
 
 		 262 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  47.06 
 
 		 275 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  45.15 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.52 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  44.4 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0091  PP-loop family protein  38.08 
 
 		 246 aa  192  6e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0135509  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  47.34 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  46.12 
 
 		 277 aa  189  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0576  methionine import ATP-binding protein MetN  45.75 
 
 		 243 aa  188  1e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1527  ABC transporter-related protein  42.19 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.330803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  41.38 
 
 		 274 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  46.29 
 
 		 259 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1155  ABC transporter related  46.55 
 
 		 278 aa  185  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1434  methionine import ATP-binding protein MetN  38.43 
 
 		 246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00844706  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  41.15 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  47.06 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  41.43 
 
 		 250 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  40.74 
 
 		 273 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  47.34 
 
 		 272 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  42.42 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  47.29 
 
 		 258 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  41.13 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  42.98 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  48.77 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  42.08 
 
 		 248 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  48.77 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  41.13 
 
 		 278 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  38.93 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  47.52 
 
 		 257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  39.52 
 
 		 248 aa  179  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  41.15 
 
 		 273 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1316  ABC transporter related  41.63 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 		 248 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  45.37 
 
 		 300 aa  177  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0492  ABC transporter related  43.66 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242272  normal  0.0865243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  41.08 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 280 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04770  ABC transporter, ATP binding component  45.89 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326188  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6242  ABC transporter, ATPase subunit  45.12 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  42.31 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2811  ABC transporter related  45.12 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2949  ABC transporter related  45.12 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85186  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  45.45 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  41.71 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  42.06 
 
 		 256 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2909  ABC transporter related  45.12 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2285  ABC transporter related  45.12 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0474  ABC transporter, ATP-binding protein  39.26 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.381498  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2900  ABC transporter related  45.12 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34746  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1914  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 264 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  45.81 
 
 		 248 aa  176  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  43.9 
 
 		 276 aa  176  6e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4224  ABC transporter, ATPase subunit  42.72 
 
 		 292 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1504  ABC transporter related  44.83 
 
 		 283 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0404  ABC transporter related  44.55 
 
 		 292 aa  175  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.027511 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  47.78 
 
 		 257 aa  175  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  40.33 
 
 		 273 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  42.17 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.12 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0065  ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0231  ABC transporter system ATP-binding protein  44.93 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0432  ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440743  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0613  ABC transporter system ATP-binding protein  44.93 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.686513  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  39.75 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  39.75 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1362  ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  39.84 
 
 		 248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0451  ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3200  ABC transporter system ATP-binding protein  44.93 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  39.75 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  38.78 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  39.75 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>