More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1047 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  100 
 
 
580 aa  1156    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  41.22 
 
 
566 aa  422  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  39.23 
 
 
577 aa  412  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  36.36 
 
 
573 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  38.48 
 
 
565 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  38.07 
 
 
567 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  37.89 
 
 
570 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  38.54 
 
 
557 aa  385  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  38.7 
 
 
554 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  36.35 
 
 
555 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  35.51 
 
 
579 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  35.51 
 
 
579 aa  382  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  35.51 
 
 
579 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  35.16 
 
 
583 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  35.33 
 
 
579 aa  378  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  37.94 
 
 
562 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  33.91 
 
 
573 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  36.05 
 
 
579 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  35.16 
 
 
579 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  35.18 
 
 
579 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  34.99 
 
 
579 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  34.99 
 
 
583 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  34.99 
 
 
579 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  38.46 
 
 
565 aa  373  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  35.75 
 
 
586 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  38.61 
 
 
558 aa  364  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  37.03 
 
 
601 aa  365  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  37.65 
 
 
588 aa  362  1e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  38.95 
 
 
599 aa  360  4e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  37.43 
 
 
556 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  34.46 
 
 
559 aa  358  9.999999999999999e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  36.48 
 
 
558 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  36.52 
 
 
574 aa  351  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  35.76 
 
 
588 aa  350  4e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  35.24 
 
 
588 aa  350  5e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  34.56 
 
 
556 aa  349  7e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  35.25 
 
 
587 aa  347  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  36.44 
 
 
554 aa  347  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  34.98 
 
 
582 aa  345  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  37.57 
 
 
560 aa  342  9e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  38.14 
 
 
553 aa  342  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  34.87 
 
 
605 aa  340  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  36.77 
 
 
557 aa  339  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  35.54 
 
 
574 aa  337  5e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0776  DNA repair protein RecN  36.16 
 
 
611 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163902  normal  0.739738 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  34.28 
 
 
552 aa  335  2e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  36.7 
 
 
552 aa  335  2e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 
572 aa  335  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  34.84 
 
 
575 aa  334  3e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  33.86 
 
 
560 aa  334  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  36.05 
 
 
561 aa  332  9e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  32.75 
 
 
558 aa  332  1e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  32.98 
 
 
595 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  34.26 
 
 
565 aa  331  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  33.57 
 
 
555 aa  331  2e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  34.33 
 
 
576 aa  329  9e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  37.54 
 
 
553 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  34.26 
 
 
565 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  34.38 
 
 
567 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 
578 aa  325  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  38.26 
 
 
561 aa  325  2e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0769  DNA repair protein RecN  36.28 
 
 
606 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  36.87 
 
 
572 aa  324  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0769  DNA repair protein RecN  36.28 
 
 
606 aa  324  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  34.74 
 
 
572 aa  324  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  36.01 
 
 
551 aa  323  4e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  32.98 
 
 
569 aa  323  5e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  32.75 
 
 
559 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  32.75 
 
 
559 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0732  DNA repair protein RecN  36.11 
 
 
606 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.813778  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  33.62 
 
 
586 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  32.74 
 
 
568 aa  320  6e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  33.05 
 
 
589 aa  319  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  36.85 
 
 
553 aa  318  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  32.38 
 
 
568 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  32.04 
 
 
608 aa  317  4e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  32.04 
 
 
556 aa  317  5e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  31.5 
 
 
562 aa  317  5e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  35.64 
 
 
560 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  33.81 
 
 
557 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  31.56 
 
 
551 aa  315  1.9999999999999998e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  32.38 
 
 
555 aa  315  1.9999999999999998e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  33.68 
 
 
574 aa  313  5.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  33.22 
 
 
553 aa  313  5.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  33.93 
 
 
549 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  33.93 
 
 
549 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  33.93 
 
 
549 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  32.33 
 
 
554 aa  312  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  33.93 
 
 
556 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  31.93 
 
 
555 aa  311  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  31.75 
 
 
555 aa  310  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0426  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 
553 aa  310  2.9999999999999997e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 
549 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 
556 aa  311  2.9999999999999997e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  34.16 
 
 
549 aa  310  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 
559 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 
549 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 
549 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 
549 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 
549 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>