More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1026 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  100 
 
 		 188 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  81.77 
 
 		 185 aa  294  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  70.65 
 
 		 189 aa  264  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  64.48 
 
 		 197 aa  236  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  69.1 
 
 		 186 aa  229  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  54.19 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  66.47 
 
 		 172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  53.48 
 
 		 186 aa  195  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  52.94 
 
 		 186 aa  195  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  52.94 
 
 		 186 aa  195  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  52.94 
 
 		 186 aa  195  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  53.48 
 
 		 186 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  52.94 
 
 		 186 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  62.22 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  49.46 
 
 		 184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  51.43 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  50.86 
 
 		 186 aa  174  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  47.8 
 
 		 189 aa  174  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  47.28 
 
 		 184 aa  174  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  52.49 
 
 		 197 aa  171  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  46.93 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  50.29 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  49.71 
 
 		 195 aa  155  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  52.57 
 
 		 187 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  52.57 
 
 		 187 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  52.57 
 
 		 187 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  52.57 
 
 		 187 aa  154  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  52.57 
 
 		 187 aa  154  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  52.57 
 
 		 187 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  52.57 
 
 		 187 aa  154  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  44.32 
 
 		 174 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  52.33 
 
 		 187 aa  150  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  48.35 
 
 		 183 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  42.53 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  44.51 
 
 		 193 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  42.27 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  42.13 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  43.18 
 
 		 188 aa  135  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  44.33 
 
 		 203 aa  134  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  43.3 
 
 		 190 aa  130  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2955  cytochrome B561  50 
 
 		 188 aa  127  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  41.08 
 
 		 203 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  43.2 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  35.9 
 
 		 222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  44.32 
 
 		 201 aa  117  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  35.38 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  44.83 
 
 		 181 aa  114  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  42.08 
 
 		 193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  41.53 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  42.78 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  38.73 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  38.73 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  37.37 
 
 		 192 aa  111  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  37.85 
 
 		 175 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  44.26 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  40.66 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  42.62 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  37.99 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  37.5 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  39.08 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  36.46 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  38.46 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  30.9 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  39.16 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  40.96 
 
 		 175 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  41.67 
 
 		 174 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  38.46 
 
 		 176 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  41.67 
 
 		 175 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  34.41 
 
 		 182 aa  104  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  39.36 
 
 		 420 aa  104  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  35.36 
 
 		 191 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  32.98 
 
 		 187 aa  104  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  34.41 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  35.16 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  37.99 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  40.86 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  41.67 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  40.86 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  39.16 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  34.46 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  38.89 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  35.75 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  38.55 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  32.78 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  33.9 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  36.84 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  37.93 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  38.55 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  37.43 
 
 		 177 aa  99.8  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  40.56 
 
 		 185 aa  99  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  34.27 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  31.69 
 
 		 183 aa  99  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  38.1 
 
 		 177 aa  99  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  34.54 
 
 		 441 aa  98.2  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  31.87 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  38.64 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  35.39 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  35 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  34.29 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  37.22 
 
 		 191 aa  95.1  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>