60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2739 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2739  putative thiamine pyrophosphokinase  100 
 
 		 229 aa  454  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641586  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  40.28 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3176  thiamine pyrophosphokinase  40.2 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0879  thiamine pyrophosphokinase  41.59 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2007  thiamine pyrophosphokinase  40.19 
 
 		 232 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0983974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0363  hypothetical protein  39.72 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0605  thiamine pyrophosphokinase  40.29 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1147  thiamine pyrophosphokinase  28.21 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.514296  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0929  thiamine pyrophosphokinase  36.61 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0683  thiamine pyrophosphokinase  36.09 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3841  thiamine pyrophosphokinase  30.22 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000017039  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2483  thiamine pyrophosphokinase  26.67 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  29.32 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000771119  normal  0.210862 
 
 
-
 
NC_004310  BR1756  hypothetical protein  33.14 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.416332  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0036  thiamine pyrophosphokinase  28.07 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000794456  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1694  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  33.72 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1143  thiamine pyrophosphokinase  34.68 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1897  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  27.81 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.327287 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2073  thiamine pyrophosphokinase  30.32 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.852638  hitchhiker  0.00000141899 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  30.46 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0039  thiamine pyrophosphokinase  31.58 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000099633  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2564  hypothetical protein  27.81 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0039  thiamine pyrophosphokinase  31.58 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10040  thiamine pyrophosphokinase  27.72 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  34.5 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2418  hypothetical protein  27.81 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0128  thiamine pyrophosphokinase  31.33 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2676  thiamine pyrophosphokinase  32.63 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0627  thiamine pyrophosphokinase  26.02 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1746  thiamine pyrophosphokinase  27.23 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511676  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2175  thiamine pyrophosphokinase  22.45 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.227177  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3105  thiamine pyrophosphokinase  33.56 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1225  thiamine pyrophosphokinase  31.36 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0480  hypothetical protein  24.86 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1805  thiamine pyrophosphokinase  26.46 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.219265  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1960  thiamine pyrophosphokinase  28.42 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  26.44 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0426  thiamine pyrophosphokinase  31.44 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5423  predicted protein  27.55 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1363  thiamine pyrophosphokinase  23.88 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4449  thiamine pyrophosphokinase  24.44 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1262  thiamine pyrophosphokinase  26.42 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.208483  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2104  thiamine pyrophosphokinase  31.18 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0906  thiamine pyrophosphokinase  23.53 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000103792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3933  thiamine pyrophosphokinase  33.93 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4124  thiamine pyrophosphokinase  26.9 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.738174  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1939  thiamine pyrophosphokinase  31.66 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611863  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08960  thiamine pyrophosphokinase  29.51 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000037051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2799  thiamine pyrophosphokinase  24.12 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3421  thiamine pyrophosphokinase  28.96 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  28.3 
 
 		 454 aa  45.4  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0473  thiamine diphosphokinase  28.57 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09380  thiamine pyrophosphokinase  28.98 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4138  thiamine pyrophosphokinase  29.12 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2511  thiamine pyrophosphokinase  23.91 
 
 		 213 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3809  thiamine pyrophosphokinase  28.65 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0230  thiamine pyrophosphokinase  27.27 
 
 		 241 aa  43.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1706  thiamine pyrophosphokinase  21.89 
 
 		 209 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2014  thiamine pyrophosphokinase  25.93 
 
 		 211 aa  42  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3682  thiamine pyrophosphokinase  25.54 
 
 		 213 aa  42  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000180795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>