More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1722 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  100 
 
 		 300 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  65.77 
 
 		 299 aa  385  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  54.3 
 
 		 307 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  53.85 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  50.68 
 
 		 298 aa  292  5e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  51.89 
 
 		 297 aa  291  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  43.84 
 
 		 324 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  45.48 
 
 		 327 aa  249  5e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  47.06 
 
 		 326 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2016  inner-membrane translocator  45.94 
 
 		 318 aa  235  8e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  41.9 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  46.86 
 
 		 407 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2500  inner-membrane translocator  47.23 
 
 		 317 aa  229  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  41.37 
 
 		 407 aa  229  3e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  45 
 
 		 415 aa  229  6e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0462  inner-membrane translocator  44.71 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3534  inner-membrane translocator  46.64 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3206  inner-membrane translocator  44.64 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01987  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  43.62 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2554  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2500  inner-membrane translocator  45.59 
 
 		 407 aa  208  9e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.62609  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0267  inner-membrane translocator  38.77 
 
 		 357 aa  207  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000311573  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2308  inner-membrane translocator  39.63 
 
 		 372 aa  206  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1386  inner-membrane translocator  44.24 
 
 		 312 aa  205  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.67 
 
 		 339 aa  205  8e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1893  branched-chain amino acid ABC transporter permease  44.16 
 
 		 362 aa  204  1e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00991478  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2430  inner-membrane translocator  40.51 
 
 		 340 aa  203  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.106551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 376 aa  203  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  42.61 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1471  inner-membrane translocator  41.5 
 
 		 353 aa  203  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0927911  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1580  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.71 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.571371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  41.88 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  43.36 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0637  inner-membrane translocator  39.67 
 
 		 347 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000477005  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1674  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4414  inner-membrane translocator  44.83 
 
 		 359 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.743887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1608  inner-membrane translocator  39.6 
 
 		 356 aa  199  5e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0142848  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  39.62 
 
 		 443 aa  199  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1395  inner-membrane translocator  40.14 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  40.26 
 
 		 317 aa  198  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0333  inner-membrane translocator  41.95 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 372 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1724  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.63 
 
 		 459 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0260  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.94 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  44.4 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1113  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 460 aa  195  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1790  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.33 
 
 		 459 aa  195  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0400  ABC transporter permease  41.03 
 
 		 316 aa  195  9e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  40.29 
 
 		 321 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1390  inner-membrane translocator  43.46 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  42.03 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0613  inner-membrane translocator  41.67 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2269  inner-membrane translocator  42.7 
 
 		 281 aa  192  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.42 
 
 		 389 aa  191  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 452 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  37.21 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3327  inner-membrane translocator  34.16 
 
 		 463 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.630335 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3514  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  35.4 
 
 		 463 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  40.14 
 
 		 389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4331  inner-membrane translocator  37.3 
 
 		 443 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157197  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5395  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 463 aa  189  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  37.65 
 
 		 389 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.25 
 
 		 389 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1778  inner-membrane translocator  39.23 
 
 		 444 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1427  inner-membrane translocator  39.78 
 
 		 286 aa  189  5e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.732914  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0065  inner-membrane translocator  37.69 
 
 		 282 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5324  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  38.59 
 
 		 446 aa  188  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538003  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  37.83 
 
 		 389 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3908  inner-membrane translocator  41.36 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3795  inner-membrane translocator  41.36 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189427 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4865  inner-membrane translocator  39.03 
 
 		 435 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307682  hitchhiker  0.00000605126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3071  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 463 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730301  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.95 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.95 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.74 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.95 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  38.44 
 
 		 418 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.95 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.95 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.95 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  40.41 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  40.43 
 
 		 562 aa  187  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  37.83 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  37.83 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  37.83 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  37.83 
 
 		 389 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4278  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.46 
 
 		 418 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  37.83 
 
 		 389 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1139  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.46 
 
 		 418 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3847  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  37.74 
 
 		 421 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0194014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4743  inner-membrane translocator  38.39 
 
 		 433 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127702  hitchhiker  0.000000177935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.46 
 
 		 418 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.46 
 
 		 418 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2933  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 356 aa  185  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  37.65 
 
 		 389 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.32 
 
 		 423 aa  185  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 389 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 389 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1621  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0814712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3337  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  36.59 
 
 		 423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>