More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3194 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 638 aa  658    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 631 aa  650    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0870  threonyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 635 aa  654    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 		 635 aa  675    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 636 aa  670    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 		 640 aa  657    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 640 aa  648    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 639 aa  651    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 639 aa  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 639 aa  650    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 635 aa  722    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 634 aa  676    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 639 aa  654    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 		 640 aa  644    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 636 aa  670    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 639 aa  703    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  51.64 
 
 		 636 aa  681    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 		 646 aa  667    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 640 aa  653    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 645 aa  661    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 		 644 aa  651    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 639 aa  651    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 640 aa  657    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 		 633 aa  706    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 645 aa  655    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 637 aa  1316    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 		 635 aa  719    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 634 aa  702    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 640 aa  647    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  50.33 
 
 		 643 aa  656    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 634 aa  665    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 639 aa  646    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 640 aa  653    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 636 aa  650    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  50.56 
 
 		 636 aa  670    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 637 aa  660    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 		 635 aa  695    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 		 635 aa  675    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 		 644 aa  641    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  50.58 
 
 		 633 aa  649    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  50.56 
 
 		 636 aa  660    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 640 aa  645    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 639 aa  652    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  50.33 
 
 		 644 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 635 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 635 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 635 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 635 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 635 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 635 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 638 aa  630  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 635 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 644 aa  629  1e-179  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 635 aa  628  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 		 649 aa  627  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 635 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 638 aa  622  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 635 aa  623  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 643 aa  622  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 635 aa  623  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 640 aa  624  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 635 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 		 644 aa  621  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 635 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 635 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 635 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 635 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 643 aa  616  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 647 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 635 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 635 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 638 aa  613  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 635 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1319  hypothetical protein  51.05 
 
 		 586 aa  610  1e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 640 aa  609  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 640 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2668  threonyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 652 aa  606  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.107403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 638 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 584 aa  608  9.999999999999999e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3623  threonyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 643 aa  605  9.999999999999999e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 640 aa  606  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 640 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  49.11 
 
 		 635 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 644 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 644 aa  603  1.0000000000000001e-171  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 640 aa  601  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 640 aa  599  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3225  threonyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 640 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 640 aa  598  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3481  threonyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 640 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800828  normal  0.0249513 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0942  threonyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 642 aa  599  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484442  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1967  threonyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 640 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134711  normal  0.0132251 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2149  threonyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 641 aa  597  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320592  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 637 aa  597  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 637 aa  596  1e-169  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 642 aa  595  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20420  threonyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 640 aa  595  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 644 aa  597  1e-169  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 644 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 644 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>