More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2534 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  45.75 
 
 		 796 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  45.1 
 
 		 827 aa  667    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  47.92 
 
 		 797 aa  716    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  47.22 
 
 		 802 aa  706    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 804 aa  1642    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  45.98 
 
 		 841 aa  663    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  46.22 
 
 		 818 aa  666    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  45.29 
 
 		 829 aa  663    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  45.43 
 
 		 773 aa  649    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  45.17 
 
 		 795 aa  685    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  44.02 
 
 		 778 aa  615  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0060  1A family penicillin-binding protein  43.2 
 
 		 852 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133649 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  42.98 
 
 		 818 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  43.74 
 
 		 862 aa  603  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0074  penicillin-binding protein, 1A family  43.51 
 
 		 852 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  43.55 
 
 		 807 aa  598  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  41.21 
 
 		 807 aa  597  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  41.94 
 
 		 807 aa  598  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0057  penicillin-binding protein 1A  43.51 
 
 		 852 aa  595  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0062  penicillin-binding protein, 1A family  43.75 
 
 		 852 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  38.83 
 
 		 831 aa  552  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  39.54 
 
 		 817 aa  533  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  37.67 
 
 		 819 aa  529  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  37.79 
 
 		 819 aa  529  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  38.53 
 
 		 814 aa  526  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  37.56 
 
 		 804 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  40.71 
 
 		 800 aa  528  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  37.94 
 
 		 794 aa  524  1e-147  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  38.4 
 
 		 794 aa  523  1e-147  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  37.27 
 
 		 819 aa  524  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.81 
 
 		 817 aa  524  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  37.88 
 
 		 846 aa  522  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1918  penicillin-binding protein, 1A family  40.37 
 
 		 812 aa  524  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.176585  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  37.26 
 
 		 831 aa  522  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  40.49 
 
 		 793 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  36.96 
 
 		 843 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  37.44 
 
 		 818 aa  515  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3405  1A family penicillin-binding protein  38.02 
 
 		 857 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0379347  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  36.52 
 
 		 835 aa  515  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  38.74 
 
 		 793 aa  514  1e-144  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  38.67 
 
 		 791 aa  511  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  37.66 
 
 		 809 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  37.36 
 
 		 817 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  38.61 
 
 		 793 aa  512  1e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  38.67 
 
 		 908 aa  511  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  40.03 
 
 		 777 aa  511  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  37 
 
 		 830 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  37.1 
 
 		 810 aa  511  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  36.91 
 
 		 819 aa  511  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  37.3 
 
 		 805 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  37.66 
 
 		 803 aa  509  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4435  penicillin-binding protein, 1A family  39.83 
 
 		 838 aa  506  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  37.65 
 
 		 804 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  40.27 
 
 		 791 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  37.9 
 
 		 818 aa  506  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  37.64 
 
 		 804 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  37.24 
 
 		 817 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  37.21 
 
 		 805 aa  505  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  37.21 
 
 		 833 aa  505  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  37.56 
 
 		 823 aa  503  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  39.68 
 
 		 797 aa  505  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  38.1 
 
 		 830 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  37.24 
 
 		 817 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  39.21 
 
 		 805 aa  502  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  37.22 
 
 		 833 aa  505  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  37.7 
 
 		 832 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  37.87 
 
 		 805 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  39.46 
 
 		 830 aa  500  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  40.97 
 
 		 803 aa  500  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  37.39 
 
 		 817 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  37.24 
 
 		 830 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  37.19 
 
 		 819 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  37.02 
 
 		 803 aa  501  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  36.72 
 
 		 823 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  36.24 
 
 		 823 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  38.92 
 
 		 779 aa  496  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  38.92 
 
 		 794 aa  499  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  37.03 
 
 		 808 aa  498  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  36.23 
 
 		 814 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  36.31 
 
 		 814 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  38.97 
 
 		 804 aa  488  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  38.58 
 
 		 824 aa  488  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2212  penicillin-binding protein 1A  35.83 
 
 		 835 aa  489  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  35.86 
 
 		 815 aa  485  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  39.35 
 
 		 792 aa  484  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  36.17 
 
 		 748 aa  483  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  39.29 
 
 		 797 aa  482  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  35.01 
 
 		 814 aa  479  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3394  penicillin-binding protein, 1A family  38.6 
 
 		 808 aa  481  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.145767  normal  0.859795 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  38.84 
 
 		 796 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3114  peptidoglycan glycosyltransferase  38.61 
 
 		 793 aa  479  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183749 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2715  penicillin-binding protein 1A  34.68 
 
 		 832 aa  478  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  38.98 
 
 		 802 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  40.6 
 
 		 777 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  40.6 
 
 		 777 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  34.71 
 
 		 796 aa  472  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  38.91 
 
 		 791 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  39.5 
 
 		 801 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  36.66 
 
 		 799 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  36.58 
 
 		 771 aa  467  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>