More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_601 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  100 
 
 
224 aa  455  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  99.11 
 
 
224 aa  449  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  99.11 
 
 
224 aa  449  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  97.77 
 
 
224 aa  444  1e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.63 
 
 
224 aa  236  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  50.69 
 
 
232 aa  232  3e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  51.61 
 
 
232 aa  232  3e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  50.69 
 
 
232 aa  231  6e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.20759e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  52.09 
 
 
228 aa  230  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.19 
 
 
213 aa  183  1e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
222 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  41.71 
 
 
234 aa  182  5e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  43.54 
 
 
218 aa  181  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 
216 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.48978e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 
216 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 
218 aa  179  3e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
216 aa  178  5e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
213 aa  178  6e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 
226 aa  178  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 
228 aa  177  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  42.08 
 
 
223 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  40.76 
 
 
222 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 
224 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 
217 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  42.4 
 
 
215 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 
220 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.2 
 
 
229 aa  175  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
237 aa  174  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
221 aa  174  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  2.10563e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.53 
 
 
253 aa  174  9e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
219 aa  174  1e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  39.64 
 
 
242 aa  174  1e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.28 
 
 
225 aa  173  2e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
223 aa  173  2e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  39.34 
 
 
234 aa  173  2e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.55 
 
 
225 aa  172  3e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 
218 aa  172  3e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.26 
 
 
239 aa  172  3e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  43.58 
 
 
230 aa  172  3e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.34 
 
 
213 aa  172  3e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 
216 aa  172  4e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 
218 aa  172  4e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
237 aa  172  4e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  42.25 
 
 
221 aa  172  4e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 
218 aa  172  4e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
212 aa  172  4e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  44.08 
 
 
213 aa  172  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
213 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  42.72 
 
 
218 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
218 aa  171  6e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0262  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.76 
 
 
225 aa  171  6e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0721339  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
214 aa  171  6e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  40.54 
 
 
223 aa  171  7e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 
211 aa  171  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 
215 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  41.71 
 
 
215 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  40.64 
 
 
226 aa  170  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
214 aa  170  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 
210 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
213 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.63 
 
 
224 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
303 aa  170  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 
218 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  41.23 
 
 
215 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.27 
 
 
224 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  41.71 
 
 
215 aa  169  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.01 
 
 
247 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.83 
 
 
222 aa  169  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.55 
 
 
226 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  41.71 
 
 
215 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  41.71 
 
 
215 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.27 
 
 
228 aa  169  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 
228 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  40.76 
 
 
215 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.9 
 
 
213 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  41.71 
 
 
215 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  41.71 
 
 
215 aa  169  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  37.62 
 
 
210 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.74821e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  40.74 
 
 
221 aa  169  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  41.71 
 
 
215 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  44.13 
 
 
209 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  44.13 
 
 
209 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.9 
 
 
213 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.85138e-07 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  44.13 
 
 
209 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  44.13 
 
 
209 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.36213e-15 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  44.13 
 
 
209 aa  169  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 
217 aa  168  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  40 
 
 
227 aa  168  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.18 
 
 
221 aa  168  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.64 
 
 
225 aa  168  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.82 
 
 
226 aa  168  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
210 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
216 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  41.59 
 
 
221 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1981  transcriptional regulatory protein DegU, putative  37.56 
 
 
218 aa  167  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  39.35 
 
 
218 aa  167  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
220 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.72 
 
 
210 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  37.62 
 
 
210 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  9.42452e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  37.62 
 
 
210 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>