More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1173 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  100 
 
 
148 aa  302  1e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  87.23 
 
 
144 aa  253  6e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  70.27 
 
 
148 aa  208  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  42.65 
 
 
141 aa  111  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  42.99 
 
 
154 aa  97.8  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  44.04 
 
 
137 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  38.66 
 
 
151 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  47.96 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  39.52 
 
 
145 aa  92  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  40.17 
 
 
269 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  9.17613e-09 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  41.18 
 
 
142 aa  86.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  37.25 
 
 
685 aa  85.1  3e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  40.82 
 
 
278 aa  84.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  40.18 
 
 
135 aa  84  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  36.52 
 
 
173 aa  83.6  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  52.78 
 
 
116 aa  82.8  1e-15  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  40.74 
 
 
123 aa  83.2  1e-15  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3133  rhodanese-like protein  42.31 
 
 
152 aa  83.2  1e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0870  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
131 aa  83.2  1e-15  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  43.9 
 
 
116 aa  80.1  9e-15  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  42.7 
 
 
271 aa  79.7  1e-14  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  41.18 
 
 
138 aa  79.3  2e-14  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  40.79 
 
 
229 aa  77.8  5e-14  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  38.68 
 
 
455 aa  77.4  6e-14  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  36.19 
 
 
129 aa  77  7e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  42.35 
 
 
222 aa  77  8e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 
141 aa  77  9e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  34.62 
 
 
141 aa  77  9e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  35.19 
 
 
136 aa  76.6  1e-13  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0957  Rhodanese domain protein  35.77 
 
 
179 aa  76.3  1e-13  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  32.71 
 
 
170 aa  75.1  3e-13  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  40.59 
 
 
279 aa  74.7  4e-13  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 
129 aa  74.7  4e-13  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  27.7 
 
 
161 aa  74.3  5e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  33.61 
 
 
170 aa  74.3  5e-13  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  33.96 
 
 
133 aa  74.3  5e-13  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  36.79 
 
 
220 aa  73.9  7e-13  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  36.36 
 
 
390 aa  73.9  8e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  37.61 
 
 
137 aa  73.6  9e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  7.89559e-05 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 
102 aa  73.6  1e-12  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  37.37 
 
 
150 aa  72.8  1e-12  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  35.78 
 
 
480 aa  73.2  1e-12  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  38.32 
 
 
142 aa  72.4  2e-12  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  45.88 
 
 
277 aa  72  2e-12  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  41.24 
 
 
116 aa  72.4  2e-12  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  5.14418e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 
125 aa  72  3e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.46 
 
 
387 aa  71.6  3e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  38.94 
 
 
132 aa  72  3e-12  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.59 
 
 
390 aa  71.6  3e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 
282 aa  72  3e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  41.18 
 
 
189 aa  71.6  3e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  9.44688e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  36.84 
 
 
198 aa  72  3e-12  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  35.2 
 
 
171 aa  71.6  3e-12  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  4.60889e-09  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  36.7 
 
 
480 aa  71.6  4e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  39.25 
 
 
201 aa  71.2  4e-12  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  37.62 
 
 
277 aa  71.2  4e-12  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  37.14 
 
 
123 aa  71.2  5e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  43.59 
 
 
189 aa  71.2  5e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  36.54 
 
 
118 aa  70.9  6e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  37.36 
 
 
131 aa  70.9  6e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0775  Rhodanese domain protein  32.14 
 
 
124 aa  70.9  6e-12  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  36.19 
 
 
113 aa  70.9  6e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  41.03 
 
 
145 aa  70.9  6e-12  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  30.71 
 
 
141 aa  70.5  7e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 
216 aa  70.5  7e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06435  rhodanese-like domain protein  43.59 
 
 
104 aa  70.5  7e-12  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  30.71 
 
 
141 aa  70.5  7e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  40.74 
 
 
122 aa  70.5  7e-12  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.78 
 
 
390 aa  70.5  8e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  35.42 
 
 
185 aa  70.1  1e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.74118e-09 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  35.71 
 
 
280 aa  69.7  1e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.00812e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  35.35 
 
 
150 aa  69.7  1e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  37.37 
 
 
114 aa  69.7  1e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  32.33 
 
 
141 aa  69.7  1e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  41.24 
 
 
129 aa  69.7  1e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  34.55 
 
 
141 aa  69.3  2e-11  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  3.98103e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06440  lipoprotein, putative  42.25 
 
 
127 aa  68.9  2e-11  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  38.1 
 
 
125 aa  69.3  2e-11  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0773  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 
117 aa  68.9  2e-11  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  31.03 
 
 
120 aa  69.3  2e-11  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.78 
 
 
568 aa  68.9  2e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  36.63 
 
 
284 aa  69.3  2e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  37.78 
 
 
290 aa  69.3  2e-11  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  42.68 
 
 
113 aa  69.3  2e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  36.7 
 
 
112 aa  68.6  3e-11  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  39.05 
 
 
138 aa  68.2  3e-11  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  39.36 
 
 
108 aa  68.6  3e-11  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  43.59 
 
 
103 aa  68.2  4e-11  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  35.51 
 
 
149 aa  68.2  4e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.71 
 
 
392 aa  68.2  4e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  31.78 
 
 
144 aa  67.8  5e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  39.8 
 
 
459 aa  67.8  5e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  38.61 
 
 
288 aa  67.8  5e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  39.8 
 
 
459 aa  67.8  5e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0580  Rhodanese domain protein  30.23 
 
 
140 aa  67.8  5e-11  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  39.8 
 
 
459 aa  67.8  5e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  35.58 
 
 
127 aa  67.8  5e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  39.77 
 
 
108 aa  67.4  6e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  36.84 
 
 
177 aa  67.4  6e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
130 aa  67  8e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>