More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0085 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  43.41 
 
 
893 aa  688    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  45.04 
 
 
894 aa  750    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  100 
 
 
885 aa  1797    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  44.22 
 
 
914 aa  669    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  44.86 
 
 
881 aa  710    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  45.88 
 
 
876 aa  773    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  45.26 
 
 
882 aa  730    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  43.54 
 
 
894 aa  682    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  42.95 
 
 
908 aa  662    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  42.23 
 
 
887 aa  711    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  41.71 
 
 
918 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  39.6 
 
 
874 aa  632  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  39.6 
 
 
874 aa  629  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  40.2 
 
 
910 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  41.3 
 
 
879 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  41.36 
 
 
901 aa  619  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  41.59 
 
 
902 aa  619  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  40.6 
 
 
906 aa  616  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  42.09 
 
 
895 aa  610  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  40.09 
 
 
877 aa  612  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  39.98 
 
 
877 aa  612  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  39.17 
 
 
939 aa  606  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  40.93 
 
 
900 aa  608  9.999999999999999e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  41.75 
 
 
879 aa  594  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  39.47 
 
 
857 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  39.66 
 
 
856 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  39.37 
 
 
856 aa  566  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  40.25 
 
 
871 aa  553  1e-156  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  39.4 
 
 
856 aa  554  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  38.4 
 
 
875 aa  552  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  38.28 
 
 
855 aa  548  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  37.95 
 
 
896 aa  543  1e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  38.07 
 
 
858 aa  544  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  39.14 
 
 
890 aa  545  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  39.49 
 
 
856 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  38 
 
 
865 aa  542  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  39.49 
 
 
855 aa  538  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  38.27 
 
 
861 aa  537  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  38.27 
 
 
861 aa  538  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  39.49 
 
 
855 aa  538  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  38.58 
 
 
855 aa  535  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  37.92 
 
 
878 aa  531  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  38.37 
 
 
861 aa  526  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  38.8 
 
 
862 aa  513  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  38.67 
 
 
886 aa  499  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  38.67 
 
 
886 aa  499  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  37.01 
 
 
883 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  38.04 
 
 
872 aa  487  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  38.77 
 
 
746 aa  463  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  40.15 
 
 
723 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  37.13 
 
 
743 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  39.43 
 
 
755 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  37.9 
 
 
751 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  37.7 
 
 
730 aa  442  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  38.91 
 
 
723 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  36.7 
 
 
727 aa  434  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  38.82 
 
 
722 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  37.1 
 
 
741 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  38.93 
 
 
730 aa  435  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  38.54 
 
 
727 aa  432  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  38.87 
 
 
748 aa  422  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  36.45 
 
 
744 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  38.14 
 
 
584 aa  243  7.999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  36.21 
 
 
664 aa  239  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  33.94 
 
 
560 aa  229  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  33.48 
 
 
622 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  36.36 
 
 
538 aa  227  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  32.3 
 
 
636 aa  225  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  32.16 
 
 
637 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  23.68 
 
 
741 aa  194  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000448446  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  31.31 
 
 
646 aa  194  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4828  Mur ligase middle domain protein  40 
 
 
576 aa  188  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  30.11 
 
 
647 aa  184  6e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  35.22 
 
 
778 aa  182  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  34.91 
 
 
778 aa  180  9e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  35.02 
 
 
328 aa  174  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  29.43 
 
 
573 aa  171  7e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1989  Mur ligase middle domain-containing protein  29.55 
 
 
427 aa  162  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  29.92 
 
 
755 aa  159  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  29.92 
 
 
755 aa  159  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  31.49 
 
 
597 aa  157  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13520  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  33.78 
 
 
725 aa  157  8e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0923131  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  24.95 
 
 
1086 aa  156  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  29.33 
 
 
757 aa  156  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  33.05 
 
 
571 aa  152  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  33.87 
 
 
593 aa  150  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  33.76 
 
 
584 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0096  hypothetical protein  28.4 
 
 
441 aa  147  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.284212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34970  Acetyltransferase GNAT family  33.01 
 
 
579 aa  146  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  35.1 
 
 
569 aa  144  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1821  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.58 
 
 
750 aa  144  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0432982  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 
593 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0815  glutathione synthase  32.47 
 
 
572 aa  142  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1972  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  33.58 
 
 
594 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0840229  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  32.92 
 
 
581 aa  141  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  30.4 
 
 
754 aa  140  7e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  32.3 
 
 
588 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  33.23 
 
 
585 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3641  glutathione synthase  29.97 
 
 
595 aa  137  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  29.86 
 
 
578 aa  136  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>