72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2675 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2675  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  296  5e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2811  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0304  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.272256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1929  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0438098  normal  0.235011 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 152 aa  50.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2043  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.831784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 179 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1072  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885065  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0098  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 189 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 314 aa  42.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0978  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4466  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120137  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 164 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 159 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 164 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 164 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 164 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 164 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 164 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 164 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 152 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 171 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 158 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 192 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 314 aa  40  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 		 166 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 145 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>