110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0179 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
404 aa  829    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  50.38 
 
 
397 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
394 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 
389 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 
398 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  37 
 
 
443 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  33.98 
 
 
741 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
422 aa  129  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  32.62 
 
 
392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  26.54 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  25.95 
 
 
407 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  32.2 
 
 
392 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  32.2 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  30.32 
 
 
443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  31 
 
 
751 aa  119  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  30.04 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  30.12 
 
 
394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
403 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  27.33 
 
 
405 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  28.08 
 
 
814 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  30.83 
 
 
783 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  25.95 
 
 
376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
390 aa  109  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
382 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  27.8 
 
 
420 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  25 
 
 
434 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
350 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  27.79 
 
 
754 aa  100  5e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  28.8 
 
 
783 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  28.68 
 
 
394 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  26.42 
 
 
1293 aa  98.6  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
395 aa  96.7  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  27.8 
 
 
1119 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 
388 aa  92.8  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.02 
 
 
477 aa  90.1  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  27.93 
 
 
412 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  26.51 
 
 
385 aa  89.4  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  27.06 
 
 
942 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.31 
 
 
427 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  27.31 
 
 
427 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  31.61 
 
 
477 aa  86.7  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 
382 aa  86.7  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  26.67 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.67 
 
 
411 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
397 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  30.35 
 
 
729 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
416 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  25.1 
 
 
370 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  22.59 
 
 
392 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  30 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.03 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
903 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 
728 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
705 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 
728 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  25.75 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
393 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  27.93 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  29.94 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  22.11 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  33.33 
 
 
416 aa  66.2  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  27.98 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  25.6 
 
 
396 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
396 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 
378 aa  59.7  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  27.27 
 
 
378 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  23.71 
 
 
380 aa  57.4  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  25.33 
 
 
726 aa  57  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 
389 aa  56.2  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  25.95 
 
 
405 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  42.86 
 
 
415 aa  54.7  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
475 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
385 aa  51.6  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  28.77 
 
 
416 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  33.58 
 
 
372 aa  50.4  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  23.94 
 
 
415 aa  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  31.97 
 
 
403 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  31.09 
 
 
394 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
373 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  20.9 
 
 
378 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.43 
 
 
377 aa  47  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0132  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
359 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00903136  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0355  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 
375 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
403 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  25.77 
 
 
385 aa  45.8  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 
390 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
441 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
904 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>