More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0992 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 255 aa  534  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  26.78 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  29.27 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  28.34 
 
 		 261 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0514  methyltransferase domain-containing protein  22.08 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  25.23 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  23.98 
 
 		 239 aa  97.1  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  31.09 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  23.88 
 
 		 239 aa  92.4  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  35.81 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  30.18 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  27.67 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  25.75 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  36.75 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  28.75 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  31.65 
 
 		 289 aa  68.6  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.03 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  31.91 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0487  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000866959 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  27.78 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  29.41 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  26.35 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  33.64 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  28.66 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  34.96 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  33.66 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  35.53 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  37 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  36.36 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  43.42 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  26.49 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  44.29 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.45 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  26.35 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  30.53 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  36.49 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  25.17 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  31.71 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  34.48 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2634  hypothetical protein  28.45 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.167376  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  31.31 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2232  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.25 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.618001  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  29.71 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  34.45 
 
 		 422 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  32.08 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  46 
 
 		 233 aa  53.9  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.67 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  43.48 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  40 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  30.33 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  35.19 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 		 1759 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  33.03 
 
 		 250 aa  52.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  40.51 
 
 		 247 aa  52.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0047  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  32.65 
 
 		 219 aa  52  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2593  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 250 aa  52  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  47.06 
 
 		 449 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5617  ribosomal L11 methyltransferase  27.27 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  27.08 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  35.87 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  25.35 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  38.57 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.7 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  28.83 
 
 		 287 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  31.62 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  31.68 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  45.1 
 
 		 463 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  45.1 
 
 		 449 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  30.12 
 
 		 280 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  30.12 
 
 		 280 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  36.05 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  41.67 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2409  hypothetical protein  29.55 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.452604  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.03 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  32.32 
 
 		 279 aa  49.7  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.92 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.77 
 
 		 237 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  31.71 
 
 		 229 aa  49.7  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  32.88 
 
 		 263 aa  49.3  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  44.19 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2978  hypothetical protein  34 
 
 		 230 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.99 
 
 		 247 aa  49.3  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  40.58 
 
 		 276 aa  49.3  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  43.14 
 
 		 463 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2640  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  41.27 
 
 		 220 aa  49.3  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>