More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0992 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  100 
 
 
255 aa  534  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  26.78 
 
 
240 aa  123  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  29.27 
 
 
241 aa  121  1e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  28.34 
 
 
261 aa  108  9e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  106  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0514  methyltransferase domain-containing protein  22.08 
 
 
242 aa  104  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  25.23 
 
 
232 aa  100  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  23.98 
 
 
239 aa  97.1  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  31.09 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  23.88 
 
 
239 aa  92.4  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  35.81 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  30.18 
 
 
294 aa  80.9  2e-14  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  27.67 
 
 
323 aa  76.6  4e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  25.75 
 
 
284 aa  76.3  5e-13  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 
267 aa  74.7  1e-12  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  36.75 
 
 
288 aa  73.9  3e-12  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
284 aa  73.2  4e-12  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  31.15 
 
 
279 aa  72.4  7e-12  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  28.75 
 
 
270 aa  70.5  3e-11  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  31.65 
 
 
289 aa  68.6  9e-11  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  31.91 
 
 
299 aa  67.8  1e-10  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.03 
 
 
275 aa  68.6  1e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0487  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 
270 aa  67  3e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000866959 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  27.78 
 
 
286 aa  64.3  2e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  29.41 
 
 
274 aa  63.5  3e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  26.35 
 
 
286 aa  61.2  1e-08  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  28.66 
 
 
291 aa  60.5  2e-08  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  34.96 
 
 
264 aa  60.8  2e-08  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  33.64 
 
 
283 aa  60.8  2e-08  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  33.66 
 
 
275 aa  59.7  5e-08  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  35.53 
 
 
218 aa  59.3  6e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  37 
 
 
270 aa  59.3  6e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  36.36 
 
 
214 aa  58.9  8e-08  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  43.42 
 
 
268 aa  58.9  8e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  26.49 
 
 
286 aa  58.5  1e-07  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  44.29 
 
 
275 aa  58.2  1e-07  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  30.53 
 
 
291 aa  57.4  2e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  26.35 
 
 
278 aa  57.4  2e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  36.49 
 
 
219 aa  57.4  2e-07  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.45 
 
 
252 aa  57.4  2e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 
266 aa  57  3e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  25.17 
 
 
283 aa  57  3e-07  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  31.71 
 
 
265 aa  56.2  5e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 
293 aa  56.2  5e-07  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  30.82 
 
 
278 aa  56.2  5e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  34.48 
 
 
278 aa  56.2  5e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  4.79797e-05 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  29.1 
 
 
287 aa  55.8  6e-07  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2634  hypothetical protein  28.45 
 
 
268 aa  55.8  7e-07  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.167376  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
253 aa  55.5  8e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  30.82 
 
 
278 aa  55.5  8e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  30.82 
 
 
278 aa  55.5  8e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  31.31 
 
 
256 aa  55.5  9e-07  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  29.71 
 
 
283 aa  55.1  1e-06  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2232  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.25 
 
 
232 aa  54.7  1e-06  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.618001  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  32.08 
 
 
279 aa  54.7  2e-06  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 
218 aa  54.3  2e-06  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  34.45 
 
 
422 aa  54.3  2e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  46 
 
 
233 aa  53.9  3e-06  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.67 
 
 
232 aa  53.5  3e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  43.48 
 
 
276 aa  53.5  3e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  40 
 
 
250 aa  53.1  4e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  30.33 
 
 
216 aa  53.1  4e-06  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  28.28 
 
 
261 aa  52.8  5e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
1759 aa  52.4  6e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  33.03 
 
 
250 aa  52.8  6e-06  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  35.19 
 
 
273 aa  52.8  6e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  40.51 
 
 
247 aa  52.4  7e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2593  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
250 aa  52  9e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0047  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  32.65 
 
 
219 aa  52  9e-06  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5617  ribosomal L11 methyltransferase  27.27 
 
 
276 aa  51.6  1e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  38.57 
 
 
253 aa  51.6  1e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  44.44 
 
 
249 aa  51.6  1e-05  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  47.06 
 
 
449 aa  51.6  1e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  31.62 
 
 
279 aa  51.6  1e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.7 
 
 
232 aa  51.6  1e-05  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  25.35 
 
 
298 aa  51.6  1e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  35.87 
 
 
247 aa  51.6  1e-05  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.07695e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  27.08 
 
 
295 aa  51.2  1e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  28.83 
 
 
287 aa  51.2  1e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  31.68 
 
 
209 aa  50.8  2e-05  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  45.1 
 
 
449 aa  51.2  2e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  45.1 
 
 
463 aa  51.2  2e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
255 aa  50.8  2e-05  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  41.67 
 
 
232 aa  50.1  3e-05  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  36.05 
 
 
258 aa  50.4  3e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  30.12 
 
 
280 aa  50.1  3e-05  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  30.12 
 
 
280 aa  50.1  3e-05  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  32.32 
 
 
279 aa  49.7  4e-05  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.03 
 
 
296 aa  50.1  4e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2409  hypothetical protein  29.55 
 
 
217 aa  49.7  4e-05  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.452604  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.92 
 
 
222 aa  49.7  4e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.77 
 
 
237 aa  49.7  5e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  32.88 
 
 
263 aa  49.3  5e-05  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  31.71 
 
 
229 aa  49.7  5e-05  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  40.58 
 
 
276 aa  49.3  6e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  43.14 
 
 
463 aa  49.3  6e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  44.19 
 
 
239 aa  49.3  6e-05  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2978  hypothetical protein  34 
 
 
230 aa  49.3  6e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.99 
 
 
247 aa  49.3  6e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.65 
 
 
236 aa  49.3  7e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60342e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>