More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2849 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2849  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
388 aa  789    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1202  nucleotide sugar dehydrogenase  89.69 
 
 
389 aa  712    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1203  UDP-glucose 6-dehydrogenase  76.29 
 
 
388 aa  627  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.699954  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2641  UDP-glucose 6-dehydrogenase  75.77 
 
 
388 aa  625  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  75.52 
 
 
388 aa  617  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112663  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00706  nucleotide sugar dehydrogenase  75.52 
 
 
388 aa  620  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0800  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  75.97 
 
 
391 aa  617  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1418  UDP-glucose 6-dehydrogenase  75.26 
 
 
388 aa  614  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001761  UDP-glucose dehydrogenase  74.48 
 
 
388 aa  615  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00992  nucleotide sugar dehydrogenase  75.45 
 
 
395 aa  617  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000137814  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1968  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.71 
 
 
389 aa  612  9.999999999999999e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01930  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.45 
 
 
388 aa  607  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.586017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1629  nucleotide sugar dehydrogenase  73.45 
 
 
388 aa  607  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00733567  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1795  nucleotide sugar dehydrogenase  73.45 
 
 
389 aa  608  1e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01916  hypothetical protein  73.45 
 
 
388 aa  607  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0591  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.97 
 
 
388 aa  610  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2205  udp-glucose 6-dehydrogenase  73.45 
 
 
388 aa  607  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3019  nucleotide sugar dehydrogenase  73.97 
 
 
397 aa  607  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0876853 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2418  udp-glucose 6-dehydrogenase  73.45 
 
 
388 aa  607  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233828 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1510  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  75.9 
 
 
390 aa  609  1e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2259  udp-glucose 6-dehydrogenase  73.45 
 
 
388 aa  607  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.389868  normal  0.025931 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1614  nucleotide sugar dehydrogenase  73.45 
 
 
388 aa  607  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2306  udp-glucose 6-dehydrogenase  73.2 
 
 
388 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0255325 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1032  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.2 
 
 
388 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2961  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.2 
 
 
388 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000204361 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1330  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.45 
 
 
388 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.143594  decreased coverage  0.000414466 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2319  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.94 
 
 
388 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.94 
 
 
388 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0186642 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0919  nucleotide sugar dehydrogenase  73.45 
 
 
388 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00213667  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1373  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.2 
 
 
388 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3483  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  73.97 
 
 
389 aa  599  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1572  nucleotide sugar dehydrogenase  72.16 
 
 
388 aa  598  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2679  nucleotide sugar dehydrogenase  72.42 
 
 
388 aa  595  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2115  DNA gyrase, subunit A  73.97 
 
 
388 aa  597  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1387  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  73.2 
 
 
388 aa  595  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.496605  hitchhiker  0.0000966488 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0720  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.13 
 
 
388 aa  592  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875671  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  71.65 
 
 
388 aa  584  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4687  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.36 
 
 
387 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1349  nucleotide sugar dehydrogenase  69.59 
 
 
388 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4273  nucleotide sugar dehydrogenase  70.62 
 
 
387 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0071  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  70.88 
 
 
387 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4328  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  70.1 
 
 
387 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4468  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  69.59 
 
 
387 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3978  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  67.53 
 
 
409 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4088  phosphoglycerate mutase  68.3 
 
 
409 aa  553  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2850  nucleotide sugar dehydrogenase  67.27 
 
 
388 aa  551  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217055  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1563  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.27 
 
 
397 aa  548  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.03127  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3885  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  67.53 
 
 
409 aa  549  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1498  nucleotide sugar dehydrogenase  64.1 
 
 
389 aa  528  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3861  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.03 
 
 
398 aa  520  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0444005  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  62.5 
 
 
491 aa  520  1e-146  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1067  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.98 
 
 
391 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.575864  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0900  hypothetical protein  59.19 
 
 
397 aa  486  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0374108 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1737  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.73 
 
 
388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.53 
 
 
372 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0958685  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0275  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase, dimerisation  53.16 
 
 
422 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0309187  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0599  nucleotide sugar dehydrogenase  48.07 
 
 
389 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0568  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.07 
 
 
389 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00339328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0592  nucleotide sugar dehydrogenase  48.07 
 
 
389 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.887508 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.11 
 
 
426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  32.89 
 
 
447 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3344  nucleotide sugar dehydrogenase  34.45 
 
 
457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.59 
 
 
442 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  32.24 
 
 
449 aa  177  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.8 
 
 
451 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  33.15 
 
 
453 aa  176  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  32.77 
 
 
437 aa  176  9e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  31.65 
 
 
427 aa  176  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  32.77 
 
 
437 aa  176  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.14 
 
 
437 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.71 
 
 
451 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  29.72 
 
 
466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5385  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.83 
 
 
457 aa  173  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.11 
 
 
450 aa  173  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1145  nucleotide sugar dehydrogenase  31.3 
 
 
444 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91161  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.42 
 
 
439 aa  172  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.83 
 
 
425 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  30.31 
 
 
440 aa  171  2e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.72 
 
 
460 aa  170  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  33.16 
 
 
464 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.44 
 
 
438 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  32.3 
 
 
449 aa  169  9e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  31.87 
 
 
450 aa  168  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  30.89 
 
 
448 aa  169  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  31.3 
 
 
440 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  33.52 
 
 
435 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  33.15 
 
 
450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  31.69 
 
 
443 aa  167  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  29.2 
 
 
450 aa  166  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1343  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.39 
 
 
440 aa  166  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0484  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.58 
 
 
446 aa  166  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323264  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  31.56 
 
 
442 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  30.71 
 
 
440 aa  166  6.9999999999999995e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  29.2 
 
 
450 aa  166  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.62 
 
 
450 aa  166  8e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.55 
 
 
443 aa  166  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.29 
 
 
434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.29 
 
 
434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.34 
 
 
447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.39 
 
 
447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>