More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1646 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1616  diguanylate phosphodiesterase  62.8 
 
 
500 aa  670    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.59158  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1646  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 
501 aa  1043    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2920  diguanylate phosphodiesterase  36.12 
 
 
511 aa  319  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal  0.688785 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2480  diguanylate phosphodiesterase  35.27 
 
 
521 aa  318  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0186873  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01143  conserved inner membrane protein  35.47 
 
 
507 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2438  diguanylate phosphodiesterase  36.42 
 
 
528 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1264  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  35.27 
 
 
521 aa  317  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0322571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01151  hypothetical protein  35.47 
 
 
507 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14530  hypothetical protein  35.53 
 
 
523 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1307  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  35.27 
 
 
521 aa  316  5e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.654083  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1286  hypothetical protein  35.86 
 
 
521 aa  316  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2458  diguanylate phosphodiesterase  35.07 
 
 
521 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.577985  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1089  diguanylate phosphodiesterase  35.26 
 
 
512 aa  309  6.999999999999999e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.725575  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2328  diguanylate phosphodiesterase  35.15 
 
 
528 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3435  diguanylate phosphodiesterase  35.15 
 
 
528 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1983  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  35.84 
 
 
486 aa  290  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.123377  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1798  diguanylate phosphodiesterase  36.63 
 
 
520 aa  289  9e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199517  normal  0.66089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2501  diguanylate phosphodiesterase  34.73 
 
 
528 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0965221  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05545  sensory transduction protein kinase  31.85 
 
 
506 aa  274  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2325  hypothetical protein  31.09 
 
 
518 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.802767  hitchhiker  0.00255877 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02106  hypothetical protein  30.88 
 
 
518 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02065  hypothetical protein  30.88 
 
 
518 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1481  diguanylate phosphodiesterase  30.88 
 
 
518 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849847  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2474  hypothetical protein  30.88 
 
 
518 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505117  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1471  hypothetical protein  30.88 
 
 
518 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000861353  normal  0.0219942 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2314  hypothetical protein  30.88 
 
 
518 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0782  hypothetical protein  31 
 
 
518 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3314  hypothetical protein  30.67 
 
 
497 aa  212  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795943  normal  0.253919 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0333  LuxR-family transcriptional regulator  41.6 
 
 
362 aa  211  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0375  LuxR-family transcriptional regulator  41.6 
 
 
362 aa  210  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.479547  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0378  LuxR-family transcriptional regulator/cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  41.6 
 
 
362 aa  210  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.200626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0346  LuxR-family transcriptional regulator  41.6 
 
 
362 aa  210  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00271  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.6 
 
 
362 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3291  diguanylate phosphodiesterase  41.6 
 
 
362 aa  209  7e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00274  hypothetical protein  41.6 
 
 
362 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3308  diguanylate phosphodiesterase  41.6 
 
 
362 aa  209  7e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2339  aminoglycoside response regulator  29.76 
 
 
526 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000320511  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3245  hypothetical protein  29.55 
 
 
528 aa  201  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0153368 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2409  hypothetical protein  31.47 
 
 
518 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.948391  hitchhiker  0.000104823 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2455  hypothetical protein  31.47 
 
 
518 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2364  hypothetical protein  31.47 
 
 
518 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000406164  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2566  hypothetical protein  31.47 
 
 
518 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233571 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2452  hypothetical protein  31.47 
 
 
518 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000990794 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2772  hypothetical protein  30.7 
 
 
518 aa  197  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  38.4 
 
 
1093 aa  193  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3538  diguanylate phosphodiesterase  28.83 
 
 
506 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.506628  decreased coverage  0.0000122226 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4488  EAL domain protein  27.98 
 
 
534 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2384  diguanylate phosphodiesterase  28.83 
 
 
532 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0705  diguanylate phosphodiesterase  28.63 
 
 
506 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3606  diguanylate phosphodiesterase  29.25 
 
 
506 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0374  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  28.29 
 
 
516 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0285785 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1280  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.36 
 
 
818 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.69 
 
 
929 aa  186  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.968718  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0849  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.71 
 
 
593 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.386146  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0820  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.71 
 
 
593 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2710  hypothetical protein  29.35 
 
 
526 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2785  hypothetical protein  29.35 
 
 
526 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0383  hypothetical protein  28.08 
 
 
516 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0298247  normal  0.0200463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0376  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  28.66 
 
 
516 aa  183  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000844741  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01785  predicted phosphodiesterase  28.69 
 
 
532 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1828  diguanylate phosphodiesterase  28.69 
 
 
532 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.566972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1818  diguanylate phosphodiesterase  28.69 
 
 
532 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0704068  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1905  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  28.69 
 
 
532 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.184783  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0396  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  28.66 
 
 
516 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0476649  hitchhiker  0.000376911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3729  diguanylate phosphodiesterase  29.52 
 
 
506 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0409  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor  37.76 
 
 
925 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.231334  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3821  rtn protein  28.43 
 
 
515 aa  181  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2544  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  28.28 
 
 
532 aa  181  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0252853  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0436  cyclic diguanylate phosphodiesterase  27.86 
 
 
516 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0237258  hitchhiker  0.0000188077 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4205  EAL domain protein  26.6 
 
 
535 aa  180  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3085  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.63 
 
 
905 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3319  sensory box protein  37.76 
 
 
733 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0669106 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1373  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  27.99 
 
 
532 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.295034  normal  0.0183228 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1183  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.08 
 
 
722 aa  178  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0717  hypothetical protein  36.95 
 
 
1245 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1268  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  27.88 
 
 
504 aa  178  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.585411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0777  EAL domain-containing protein  32.12 
 
 
519 aa  178  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2811  EAL domain-containing protein  39.36 
 
 
538 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0950  putative membrane associated signaling protein  28.82 
 
 
476 aa  176  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0172619  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3503  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.58 
 
 
1101 aa  176  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3192  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.75 
 
 
736 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2450  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.4 
 
 
951 aa  175  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.065238  normal  0.870771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0308  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.17 
 
 
541 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3579  hypothetical protein  34.44 
 
 
685 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0227937  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0689  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.04 
 
 
723 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.452404 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0902  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.45 
 
 
718 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.651526  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0518  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  27.59 
 
 
516 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00021587  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.96 
 
 
962 aa  174  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5276  putative signal transduction protein  27.03 
 
 
529 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134868  normal  0.223865 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2028  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  27.72 
 
 
533 aa  174  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.78 
 
 
1514 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.78 
 
 
1514 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.13 
 
 
1212 aa  173  6.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.4231 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0568  diguanylate cyclase  38.46 
 
 
586 aa  173  6.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001510  Rtn protein  28.47 
 
 
490 aa  173  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03877  Putative signal protein with EAL domain  37.65 
 
 
374 aa  173  7.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2716  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.66 
 
 
629 aa  173  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0509  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  27.27 
 
 
516 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000640721  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0528  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  27.59 
 
 
516 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000439808  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1710  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.19 
 
 
720 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.425295  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>