More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0719 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
400 aa  760    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  65.48 
 
 
433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  67.73 
 
 
384 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  62.66 
 
 
394 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  62.3 
 
 
376 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  59.37 
 
 
398 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  59.37 
 
 
398 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  46.84 
 
 
404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  50.41 
 
 
410 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  47.55 
 
 
407 aa  322  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  47.21 
 
 
403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  48.5 
 
 
402 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  47.68 
 
 
398 aa  319  5e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  49.45 
 
 
410 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  47.15 
 
 
402 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  46.91 
 
 
397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  46.9 
 
 
402 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  47.19 
 
 
400 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  50 
 
 
420 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  44.7 
 
 
401 aa  310  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  48.33 
 
 
411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  46.56 
 
 
404 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  46.36 
 
 
404 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  49.09 
 
 
408 aa  299  5e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  48.1 
 
 
409 aa  295  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  45.45 
 
 
376 aa  289  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  45.86 
 
 
408 aa  286  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  50.43 
 
 
402 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  45.87 
 
 
403 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  45.87 
 
 
403 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 
395 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  43.48 
 
 
401 aa  279  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 
416 aa  276  5e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  37.78 
 
 
451 aa  270  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 
412 aa  270  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  37.78 
 
 
451 aa  270  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  37.78 
 
 
451 aa  270  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  37.78 
 
 
451 aa  270  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  37.78 
 
 
451 aa  270  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  48.28 
 
 
402 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  39.24 
 
 
396 aa  269  7e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  43.33 
 
 
413 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  37.66 
 
 
394 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  43.7 
 
 
403 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 
396 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  43.02 
 
 
403 aa  256  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  43.12 
 
 
379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  41.07 
 
 
403 aa  252  7e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  42.74 
 
 
400 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  41.32 
 
 
408 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  42.45 
 
 
400 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  42.02 
 
 
403 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  42.45 
 
 
399 aa  249  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  38.68 
 
 
401 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  36.5 
 
 
400 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  41.44 
 
 
395 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  35.66 
 
 
412 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 
397 aa  176  9e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  32.64 
 
 
399 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 
415 aa  166  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  31.67 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  33.89 
 
 
415 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 
402 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  35.41 
 
 
410 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  33.89 
 
 
402 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  30.95 
 
 
408 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 
402 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  31.2 
 
 
406 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  33.07 
 
 
408 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  30.69 
 
 
413 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  33.07 
 
 
408 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 
422 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  32.44 
 
 
394 aa  143  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 
397 aa  137  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22240  arabinose efflux permease family protein  30.79 
 
 
409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 
735 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  29.38 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  32.29 
 
 
397 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1543  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 
387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329427  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  25.89 
 
 
404 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  34.87 
 
 
390 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  29.55 
 
 
392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  28.65 
 
 
399 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  28.09 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  29.28 
 
 
404 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  31.2 
 
 
405 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  29.94 
 
 
391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  29.46 
 
 
383 aa  111  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 
390 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  29.64 
 
 
391 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  29.94 
 
 
391 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  30.24 
 
 
391 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  30.51 
 
 
396 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  29.47 
 
 
399 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  29.22 
 
 
405 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 
403 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  28.9 
 
 
402 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>