More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2147 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 415 aa  846    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  69.66 
 
 		 413 aa  615  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  67.88 
 
 		 413 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  66.1 
 
 		 412 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  69.12 
 
 		 417 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  67.66 
 
 		 417 aa  570  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  66.11 
 
 		 415 aa  566  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  67.4 
 
 		 411 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  67 
 
 		 413 aa  565  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  67.32 
 
 		 420 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  67.42 
 
 		 418 aa  558  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 		 416 aa  558  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 		 415 aa  555  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 		 415 aa  553  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  65.04 
 
 		 412 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  65.93 
 
 		 415 aa  550  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  65.2 
 
 		 415 aa  546  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 		 412 aa  543  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  65.2 
 
 		 412 aa  541  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 		 412 aa  543  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  65.2 
 
 		 415 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  65.12 
 
 		 414 aa  540  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  67.72 
 
 		 413 aa  538  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  63.7 
 
 		 413 aa  535  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  63.7 
 
 		 414 aa  535  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  63.7 
 
 		 414 aa  535  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  63.08 
 
 		 416 aa  535  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  63.46 
 
 		 413 aa  535  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  63.7 
 
 		 413 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  64.71 
 
 		 415 aa  537  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  63.95 
 
 		 413 aa  536  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 		 412 aa  536  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  63.7 
 
 		 413 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  61.43 
 
 		 412 aa  534  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  64.41 
 
 		 413 aa  534  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  63.46 
 
 		 414 aa  532  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  63.46 
 
 		 413 aa  531  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  65.87 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  63.91 
 
 		 413 aa  530  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  62.75 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  61.89 
 
 		 417 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  61.92 
 
 		 410 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  61.41 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 		 419 aa  521  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 		 429 aa  522  1e-147  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  61.65 
 
 		 417 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  61.43 
 
 		 410 aa  522  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  64.02 
 
 		 414 aa  521  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  61.11 
 
 		 417 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  61.58 
 
 		 422 aa  520  1e-146  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  61.67 
 
 		 431 aa  518  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  61.18 
 
 		 415 aa  518  1e-146  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  68.1 
 
 		 412 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  61.15 
 
 		 431 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  61.67 
 
 		 427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 414 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  63.9 
 
 		 420 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  61.58 
 
 		 414 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3847  Glycine hydroxymethyltransferase  62.23 
 
 		 420 aa  513  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  62.87 
 
 		 412 aa  513  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  67.29 
 
 		 412 aa  513  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  60.91 
 
 		 431 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  60.67 
 
 		 431 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 		 411 aa  509  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 423 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  56.72 
 
 		 423 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3468  serine hydroxymethyltransferase  64.94 
 
 		 418 aa  506  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  60.68 
 
 		 438 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1264  serine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 		 426 aa  504  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  57.87 
 
 		 425 aa  505  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  58.99 
 
 		 438 aa  503  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 423 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  68.36 
 
 		 412 aa  503  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  58.5 
 
 		 424 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0603  serine hydroxymethyltransferase  59.46 
 
 		 416 aa  498  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  57.88 
 
 		 412 aa  499  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 		 415 aa  498  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  63.71 
 
 		 412 aa  500  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  61.76 
 
 		 434 aa  498  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  61.76 
 
 		 434 aa  498  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 435 aa  498  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 		 474 aa  499  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  61.5 
 
 		 434 aa  498  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  60.53 
 
 		 422 aa  499  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  55.75 
 
 		 423 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  58.02 
 
 		 436 aa  499  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  58.92 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1551  serine hydroxymethyltransferase  59.46 
 
 		 416 aa  494  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 416 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 411 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 		 417 aa  494  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  61.08 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  58.88 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  58.88 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  60.38 
 
 		 432 aa  495  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 414 aa  495  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0389  serine hydroxymethyltransferase  57.55 
 
 		 436 aa  496  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>