More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4173 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4173  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 458 aa  914    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2147  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like  52.03 
 
 		 590 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2761  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  52.03 
 
 		 590 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.054979  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  52.67 
 
 		 584 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2813  Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  51.47 
 
 		 609 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0320  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  51.6 
 
 		 565 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  52.99 
 
 		 580 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  51.28 
 
 		 565 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2680  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like protein  51.68 
 
 		 609 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  48.52 
 
 		 570 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2746  CoA ligase (AMP forming)  52.8 
 
 		 443 aa  401  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.913246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  49.27 
 
 		 593 aa  396  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0802  AMP-binding protein  49 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2671  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  47.37 
 
 		 569 aa  352  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1318  putative CoA ligase (AMP forming)  49.56 
 
 		 466 aa  350  4e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3987  hypothetical protein  43.11 
 
 		 448 aa  345  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0350  peptide synthase  43.08 
 
 		 450 aa  311  2e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.693872  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0315  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  43.08 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.529021  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0480  AMP-dependent synthetase and ligase  44.34 
 
 		 446 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.872653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03741  AMP-ligase  44.27 
 
 		 501 aa  293  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0893  putative AMP-binding protein  30.72 
 
 		 457 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639204  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0437  AMP-binding enzyme  21.98 
 
 		 448 aa  110  8.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.219492  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  28.92 
 
 		 565 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004067  putative surfactin synthetase  25.52 
 
 		 466 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 		 551 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  28.61 
 
 		 451 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  28.24 
 
 		 591 aa  94.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 		 561 aa  92.8  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3891  hypothetical protein  25.78 
 
 		 459 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 		 557 aa  91.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2100  hypothetical protein  27.24 
 
 		 457 aa  91.3  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3889  AMP-dependent synthetase and ligase  26.59 
 
 		 453 aa  89.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.329532 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3382  hypothetical protein  27.36 
 
 		 459 aa  88.6  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  26.74 
 
 		 504 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0322  hypothetical protein  25.46 
 
 		 454 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168086 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0344  aconitate hydratase  26.08 
 
 		 454 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  31.13 
 
 		 568 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0337  aconitate hydratase  25.85 
 
 		 454 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2105  aconitate hydratase  26.81 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  30.93 
 
 		 501 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  31.28 
 
 		 501 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0115  acyl-coenzyme A synthetase-related protein  28.25 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0349  hypothetical protein  27.41 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0443  hypothetical protein  26.5 
 
 		 454 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  30.03 
 
 		 615 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  26.55 
 
 		 503 aa  81.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4371  hypothetical protein  25.87 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  25.27 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4599  hypothetical protein  25.06 
 
 		 454 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0339  aconitate hydratase  25.64 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0347  hypothetical protein  25.85 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166165 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7294  AMP-dependent synthetase and ligase  27.98 
 
 		 498 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555041  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1890  putative acid-CoA ligase  26.23 
 
 		 515 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.367051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  25.13 
 
 		 518 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  26.98 
 
 		 485 aa  79.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  25.28 
 
 		 506 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  30.58 
 
 		 562 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1765  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 		 514 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459624  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1000  AMP-dependent synthetase and ligase  24.88 
 
 		 573 aa  77.4  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00216584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  26.05 
 
 		 511 aa  77  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  28.26 
 
 		 563 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3514  hypothetical protein  26.1 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0347  hypothetical protein  26.04 
 
 		 454 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3679  hypothetical protein  26.04 
 
 		 454 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0338  aconitate hydratase  26.48 
 
 		 454 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  26.11 
 
 		 530 aa  76.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  28.29 
 
 		 559 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  27.23 
 
 		 510 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  25.2 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  27.81 
 
 		 509 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2785  AMP-dependent synthetase and ligase  26.35 
 
 		 534 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634484  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  23.9 
 
 		 503 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  28.53 
 
 		 557 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  23.9 
 
 		 511 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  28.53 
 
 		 557 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  27.42 
 
 		 510 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3252  AMP-dependent synthetase and ligase  22.55 
 
 		 474 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  26.39 
 
 		 512 aa  72.8  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  26.67 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.28 
 
 		 514 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  25.98 
 
 		 523 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0133  AMP-dependent synthetase and ligase  24.36 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  25.34 
 
 		 555 aa  71.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  23.6 
 
 		 500 aa  70.5  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  25.86 
 
 		 506 aa  70.9  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  27.01 
 
 		 507 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  25.41 
 
 		 543 aa  70.1  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  27.78 
 
 		 527 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  25.68 
 
 		 509 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  24.17 
 
 		 521 aa  69.3  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  24.8 
 
 		 526 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  23.66 
 
 		 503 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3032  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  26.54 
 
 		 536 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0645  enterobactin synthase subunit E  26.54 
 
 		 536 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6948  benzoate-CoA ligase family  27.25 
 
 		 535 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3050  enterobactin synthase subunit E  26.54 
 
 		 536 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.42 
 
 		 1829 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  24.18 
 
 		 510 aa  67.8  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  23.74 
 
 		 533 aa  67.4  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  26.5 
 
 		 549 aa  67.4  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>